RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527118.5

RBBP4-218, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-218ENST00000527118 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.33■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 PARP10Q53GL7 1025 aa20.32■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.32■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.31■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.31■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 HOXB7P09629 217 aa20.3■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF853P0CG23 659 aa20.3■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF428Q96B54 188 aa20.3■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 TAF1P21675 1872 aa20.3■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 APLP1P51693 650 aa20.29■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.29■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.29■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 IFT57Q9NWB7 429 aa20.29■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 POTECB2RU33 542 aa20.28■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 FSTL1Q12841 308 aa20.28■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 TCIRG1Q13488 830 aa20.28■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 SLC51AQ86UW1 340 aa20.28■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 NLRP10Q86W26 655 aa20.28■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 GNAI1P63096 354 aa20.27■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 SYNE4Q8N205 404 aa20.27■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 NLRP3Q96P20 1036 aa20.27■□□□□ 0.84
RBBP4-218ENST00000527118 SNED1Q8TER0 1413 aa20.27■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.26■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 SCN4AP35499 1836 aa20.25■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.25■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.25■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.25■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.25■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 HTRA3P83110 453 aa20.24■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 HYPKQ9NX55 129 aa20.24■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.24■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.24■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 ANP32CO43423 234 aa20.23■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.23■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 PSMD1Q99460 953 aa20.23■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 MRS2Q9HD23 443 aa20.23■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.23■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 COL4A5P29400 1685 aa20.22■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.22■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.22■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 ABCC4O15439 1325 aa20.22■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.21■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RBBP4-218ENST00000527118 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.19■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.19■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 TSPYL6Q8N831 410 aa20.19■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 FZD9O00144 591 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 POTEIP0CG38 1075 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 POTEJP0CG39 1038 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 WWC1Q8IX03 1113 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 JDP2Q8WYK2 163 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 FAM89AQ96GI7 184 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.18■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 GOLGA2Q08379 1002 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 CCDC27Q2M243 656 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.17■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.16■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 MYD88Q99836 296 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 COL4A1P02462 1669 aa20.15■□□□□ 0.82
RBBP4-218ENST00000527118 LTBP1Q14766 1721 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 BBOX1O75936 387 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 GRAPQ13588 217 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 CHADLQ6NUI6 762 aa20.14■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 PPIP5K2O43314 1243 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 AOC3Q16853 763 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 SP8Q8IXZ3 490 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 GPC2Q8N158 579 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 HACL1Q9UJ83 578 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.13■□□□□ 0.81
RBBP4-218ENST00000527118 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.13■□□□□ 0.81
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