RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.66■■■□□ 2.18
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TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
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TSNARE1-208ENST00000524325 CSF1RP07333 972 aa28.38■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 NLRP3Q96P20 1036 aa28.38■■■□□ 2.13
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TSNARE1-208ENST00000524325 PTGER2P43116 358 aa28.37■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.37■■■□□ 2.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.37■■■□□ 2.13
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