RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521993.2

ERLIN2-209, Transcript of ER lipid raft associated 2, human

TSL 3

Gene ERLIN2, Length 764 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERLIN2-209	ENST00000521993	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	EPS15	P42566	896 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	CA12	O43570	354 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	SCNN1D	P51172	638 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	GRM1	Q13255	1194 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	HLF	Q16534	295 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	CST9	Q5W186	159 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.11	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRAF5	O00463	557 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	MCM10	Q7L590	875 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ERLIN2-209	ENST00000521993	AOC2	O75106	756 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.06	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	COL4A5	P29400	1685 aa		13.05	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.05	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.05	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.05	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.05	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	GPT	P24298	496 aa		13.04	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	CXCL9	Q07325	125 aa		13.04	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	DGKZ	Q13574	1117 aa		13.04	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	AOC3	Q16853	763 aa		13.04	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.04	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.04	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.04	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.04	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	NOG	Q13253	232 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	TNIP1	Q15025	636 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	RALBP1	Q15311	655 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.03	□□□□□ -0.32
ERLIN2-209	ENST00000521993	BBOX1	O75936	387 aa		13.02	□□□□□ -0.33
ERLIN2-209	ENST00000521993	NTSR2	O95665	410 aa		13.02	□□□□□ -0.33
ERLIN2-209	ENST00000521993	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
ERLIN2-209	ENST00000521993	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.02	□□□□□ -0.33
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.02	□□□□□ -0.33
ERLIN2-209	ENST00000521993	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
ERLIN2-209	ENST00000521993	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.02	□□□□□ -0.33
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.02	□□□□□ -0.33
ERLIN2-209	ENST00000521993	NEFM	P07197	916 aa		13.01	□□□□□ -0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms