RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP31Q70CQ4 1352 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FGRP09769 529 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP17L7P0C7H9 530 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAK2Q13177 524 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP20Q9Y2K6 914 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBX22Q9Y458 520 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GIPC1O14908 333 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNFRSF21O75509 655 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTGIRP43119 386 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNC4Q03721 635 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHMP4AQ9BY43 222 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLA2G4AP47712 749 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GJA8P48165 433 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPRASP2Q96D09 838 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COPRSQ9NQ92 184 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IDH3AP50213 366 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RELBQ01201 579 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NNTQ13423 1086 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AIDAQ96BJ3 306 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPHS2Q9NP85 383 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHACTR2O75167 634 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNASQ5JWF2 1037 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLRG1Q96E93 195 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUSD3Q96L08 255 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WNT7AO00755 349 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALDH1A1P00352 501 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCEAL1Q15170 157 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIF1AQ16665 826 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q6ZVU0 165 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCO2Q9BYV7 579 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C4orf17Q53FE4 359 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XKR5Q6UX68 686 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITPKCQ96DU7 683 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPACA7Q96KW9 195 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELP3Q9H9T3 547 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F6X3S4 739 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHKA2P46019 1235 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARSDP51689 593 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFE2L2Q16236 605 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPON2Q9BUD6 331 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IER5Q5VY09 327 aa7.1□□□□□ -1.27
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