RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIX5Q8N196 739 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNMA5Q96PV4 448 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUDT8Q8WV74 236 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 HINFPQ9BQA5 517 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 DYRK3O43781 588 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEC13P55735 322 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAC1P63000 192 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 C9orf172C9J069 976 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 C21orf2O43822 256 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 POTEAQ6S8J7 498 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A0A0MRY4 1105 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 LGR5O75473 907 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 ELNP15502 786 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 NFKB1P19838 968 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCINQ13939 588 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLMNQ92990 594 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP21Q9UK80 565 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPB42P16452 691 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBTPS1Q14703 1052 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 RTN1Q16799 776 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSX2Q9BZM3 304 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 EFCC1Q9HA90 598 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 DKK1O94907 266 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 SELPP16109 830 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPYDQ12882 1025 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADGRE1Q14246 886 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM35AQ86V20 835 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPB1P15086 417 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 IER5Q5VY09 327 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 NBPF11Q86T75 865 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 NAGPAQ9UK23 515 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCSK7Q16549 785 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 TP53INP1Q96A56 240 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLK14Q9P0G3 267 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 IDH3AP50213 366 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCS1LQ9Y276 419 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGFBP4P22692 258 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 DGKZQ13574 1117 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARTNQ5T4W7 220 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L15C9J2P7 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L10C9JJH3 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L12C9JPN9 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L11C9JVI0 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L21D6R901 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L18D6R9N7 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L22D6RA61 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L19D6RCP7 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L20D6RJB6 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 RARAP10276 462 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARSDP51689 593 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L24Q0WX57 530 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTK7Q13308 1070 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 MSL1Q68DK7 614 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms