RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC6A14Q9UN76 642 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR64B1ANS9 1081 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLB1P16278 677 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPSM3Q9Y4H4 160 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRC10BA6NIK2 292 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNRH1P01148 92 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 SKIP12755 728 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP2K5Q13163 448 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHISA5Q8N114 240 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 CXorf38Q8TB03 319 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R16BQ96T49 567 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM83CQ9BQN1 747 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 F13BP05160 661 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLCN1P35523 988 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTK2Q05397 1052 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPEM2Q0P670 501 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 RTEL1Q9NZ71 1219 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPIPB6E9PJ23 425 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 IRF6O14896 467 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 QPCTQ16769 361 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 UVSSAQ2YD98 709 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC10AQ8IUN9 316 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD320Q9NPF0 282 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-871P-201ENST00000516122 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 NFIXQ14938 502 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 MLANAQ16655 118 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM20CQ8IXL6 584 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSC1Q92574 1164 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 MFSD14AQ96MC6 490 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SORCS2Q96PQ0 1159 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNC2Q96PR1 638 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LPIN3Q9BQK8 851 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LEMD3Q9Y2U8 911 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 WISP1O95388 367 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 STAU1O95793 577 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 INSRRP14616 1297 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFEMP1Q12805 493 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPRED2Q7Z698 418 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC16A11Q8NCK7 471 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBC1D2Q9BYX2 928 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 TM4SF5O14894 197 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFRSF1AP19438 455 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLCL1Q15111 1095 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP2□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRB2Q5IJ48 1285 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 WFDC8Q8IUA0 241 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LILRB3O75022 631 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZXDAP98168 799 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNA10Q16322 511 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 BEND4Q6ZU67 534 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRN4CLQ8ND94 238 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 C7orf43Q8WVR3 580 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYRFQ9Y2G1 1151 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNQ4P56696 695 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SETDB1Q15047 1291 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 NR6A1Q15406 480 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM117BQ6P1L5 589 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC102AQ96A19 550 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 AIDAQ96BJ3 306 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC4A9Q96Q91 983 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 ETNK1Q9HBU6 452 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRIM1Q9NZV1 1036 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRRS1LQ9P0K9 344 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa1.97□□□□□ -2.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTDSPL2Q05D32 466 aa1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms