RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512737.5

NME2-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME2, Length 826 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NME2-205	ENST00000512737	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	PDIA6	Q15084	440 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	PARP10	Q53GL7	1025 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	PSMD1	Q99460	953 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	LAMB2	P55268	1798 aa		32.68	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		32.68	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.68	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.67	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	ANXA1	P04083	346 aa		32.66	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	LDHD	Q86WU2	507 aa		32.66	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.65	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		32.65	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	FZD9	O00144	591 aa		32.64	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.64	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		32.64	■■■□□ 2.82
NME2-205	ENST00000512737	COL4A5	P29400	1685 aa		32.63	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.63	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.63	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	CREBZF	Q9NS37	354 aa		32.63	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.63	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		32.62	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		32.62	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.62	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	NLRP3	Q96P20	1036 aa		32.61	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.6	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	GPC2	Q8N158	579 aa		32.6	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	EPHX2	P34913	555 aa		32.59	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		32.59	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.59	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.59	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	CHL1	O00533	1208 aa		32.58	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.58	■■■□□ 2.81
NME2-205	ENST00000512737	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.57	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	SLC51A	Q86UW1	340 aa		32.57	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.57	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	PASK	Q96RG2	1323 aa		32.56	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		32.56	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.56	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.55	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.54	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	LTBP1	Q14766	1721 aa		32.54	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	ABCC4	O15439	1325 aa		32.53	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.53	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		32.53	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.53	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		32.52	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	TAF1	P21675	1872 aa		32.52	■■■□□ 2.8
NME2-205	ENST00000512737	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.51	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.51	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	CNTNAP1	P78357	1384 aa		32.49	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	HOXB7	P09629	217 aa		32.49	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.49	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		32.49	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	PPIP5K2	O43314	1243 aa		32.48	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		32.47	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	AOC3	Q16853	763 aa		32.46	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		32.46	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	BBOX1	O75936	387 aa		32.45	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	CNTROB	Q8N137	903 aa		32.45	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		32.45	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.45	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	VPS33B	Q9H267	617 aa		32.45	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
NME2-205	ENST00000512737	SCNN1D	P51172	638 aa		32.44	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.44	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	SP8	Q8IXZ3	490 aa		32.43	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	GRAP	Q13588	217 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	TNS4	Q8IZW8	715 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		32.4	■■■□□ 2.78
NME2-205	ENST00000512737	EPS15	P42566	896 aa		32.4	■■■□□ 2.78

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