RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
ALYREF-202ENST00000505490 PDIA6Q15084 440 aa39.83■■■■□ 3.97
ALYREF-202ENST00000505490 BABAM1Q9NWV8 329 aa39.83■■■■□ 3.97
ALYREF-202ENST00000505490 HACL1Q9UJ83 578 aa39.82■■■■□ 3.97
ALYREF-202ENST00000505490 COL4A5P29400 1685 aa39.82■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 GPTP24298 496 aa39.81■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 GRIPAP1Q4V328 841 aa39.81■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 CRAMP1Q96RY5 1269 aa39.81■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 GPC2Q8N158 579 aa39.8■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 TSPYL4Q9UJ04 414 aa39.79■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 EPHX2P34913 555 aa39.78■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 CNTNAP1P78357 1384 aa39.78■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 RALBP1Q15311 655 aa39.76■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 PARP10Q53GL7 1025 aa39.76■■■■□ 3.96
ALYREF-202ENST00000505490 RIPK4P57078 832 aa39.75■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 SLC10A5Q5PT55 438 aa39.75■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 RNF123Q5XPI4 1314 aa39.74■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 C3orf67Q6ZVT6 689 aa39.74■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa39.74■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 JDP2Q8WYK2 163 aa39.74■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 LTBP1Q14766 1721 aa39.72■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 TMPOP42166 694 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 TNS4Q8IZW8 715 aa39.72■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 PROSER3Q2NL68 480 aa39.71■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa39.71■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM88BA6NKF7 163 aa39.7■■■■□ 3.95
ALYREF-202ENST00000505490 SLC51AQ86UW1 340 aa39.69■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 LMOD3Q0VAK6 560 aa39.67■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 NLRP3Q96P20 1036 aa39.67■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 EIF6P56537 245 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 LAMB2P55268 1798 aa39.65■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 CNTROBQ8N137 903 aa39.65■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 VPS33BQ9H267 617 aa39.64■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 CLEC11AQ9Y240 323 aa39.64■■■■□ 3.94
ALYREF-202ENST00000505490 ANXA1P04083 346 aa39.63■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 SCNN1DP51172 638 aa39.63■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 LARGE2Q8N3Y3 721 aa39.63■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa39.63■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 CHL1O00533 1208 aa39.61■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 VEGFBP49765 207 aa39.61■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 COPS6Q7L5N1 327 aa39.6■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 ABCC4O15439 1325 aa39.6■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 RASSF10A6NK89 507 aa39.59■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa39.59■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 NLRP10Q86W26 655 aa39.59■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP39.58■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 GJA3Q9Y6H8 435 aa39.58■■■■□ 3.93
ALYREF-202ENST00000505490 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 FOXN1O15353 648 aa39.56■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 EPS15P42566 896 aa39.56■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 TCIRG1Q13488 830 aa39.56■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 XAGE3Q8WTP9 111 aa39.56■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM35Q9UPQ4 493 aa39.56■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 BBOX1O75936 387 aa39.55■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 NIM1KQ8IY84 436 aa39.54■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 PPIP5K2O43314 1243 aa39.53■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 SP8Q8IXZ3 490 aa39.53■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 AOC3Q16853 763 aa39.52■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 KRT24Q2M2I5 525 aa39.52■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 WBP1LQ9NX94 342 aa39.52■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 PRDM10Q9NQV6 1147 aa39.51■■■■□ 3.92
ALYREF-202ENST00000505490 DEFB115Q30KQ5 88 aa39.5■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 SUPT20HQ8NEM7 779 aa39.5■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 NECTIN2Q92692 538 aa39.5■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 RUNDC1Q96C34 613 aa39.5■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 HOXB7P09629 217 aa39.49■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC146Q8IYE0 955 aa39.49■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 SH3TC1Q8TE82 1336 aa39.48■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 TRPM7Q96QT4 1865 aa39.48■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 GPRC5DQ9NZD1 345 aa39.48■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 ZNRF3Q9ULT6 936 aa39.48■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 CAPN15O75808 1086 aa39.47■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 CXCL9Q07325 125 aa39.47■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC37AA6NMS7 1700 aa39.47■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 TAF1P21675 1872 aa39.47■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 THSD7BQ9C0I4 1608 aa39.46■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 KIAA2012Q0VF49 1180 aa39.45■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 GRAPQ13588 217 aa39.45■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 NEUROD2Q15784 382 aa39.45■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 CHPF2Q9P2E5 772 aa39.45■■■■□ 3.91
ALYREF-202ENST00000505490 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms