RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 GLTPD2A6NH11 291 aa25.21■■□□□ 1.63
USP40-217ENST00000496298 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.21■■□□□ 1.63
USP40-217ENST00000496298 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.21■■□□□ 1.63
USP40-217ENST00000496298 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.2■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 TCIRG1Q13488 830 aa25.2■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 CCDC27Q2M243 656 aa25.2■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 CCDC93Q567U6 631 aa25.19■■□□□ 1.62
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USP40-217ENST00000496298 MRS2Q9HD23 443 aa25.18■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 HYPKQ9NX55 129 aa25.18■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.17■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 RRAGCQ9HB90 399 aa25.17■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 HSPA6P17066 643 aa25.16■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.16■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.16■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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USP40-217ENST00000496298 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.16■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
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USP40-217ENST00000496298 OLFM4Q6UX06 510 aa25.14■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.14■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 WWC1Q8IX03 1113 aa25.14■■□□□ 1.62
USP40-217ENST00000496298 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.14■■□□□ 1.62
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USP40-217ENST00000496298 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.13■■□□□ 1.61
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USP40-217ENST00000496298 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.12■■□□□ 1.61
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USP40-217ENST00000496298 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
USP40-217ENST00000496298 IL16Q14005 1332 aa25.11■■□□□ 1.61
USP40-217ENST00000496298 POTECB2RU33 542 aa25.1■■□□□ 1.61
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USP40-217ENST00000496298 FSTL1Q12841 308 aa25.09■■□□□ 1.61
USP40-217ENST00000496298 SYNE4Q8N205 404 aa25.09■■□□□ 1.61
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USP40-217ENST00000496298 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.03■■□□□ 1.6
USP40-217ENST00000496298 WDR63Q8IWG1 891 aa25.03■■□□□ 1.6
USP40-217ENST00000496298 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.03■■□□□ 1.6
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USP40-217ENST00000496298 SCN4AP35499 1836 aa25.02■■□□□ 1.6
USP40-217ENST00000496298 TAF1P21675 1872 aa25.02■■□□□ 1.6
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USP40-217ENST00000496298 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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USP40-217ENST00000496298 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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USP40-217ENST00000496298 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.96■■□□□ 1.59
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USP40-217ENST00000496298 TMC4Q7Z404 712 aa24.96■■□□□ 1.59
USP40-217ENST00000496298 MYD88Q99836 296 aa24.96■■□□□ 1.59
USP40-217ENST00000496298 STK31Q9BXU1 1019 aa24.96■■□□□ 1.59
USP40-217ENST00000496298 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.95■■□□□ 1.58
USP40-217ENST00000496298 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
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