RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491084.5

KRTCAP2-208, Transcript of keratinocyte associated protein 2, human

TSL 3

Gene KRTCAP2, Length 598 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PDIA6	Q15084	440 aa		13.91	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.91	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NUP98	P52948	1817 aa		13.91	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	APAF1	O14727	1248 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NTSR2	O95665	410 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	RRAGC	Q9HB90	399 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.9	□□□□□ -0.18
KRTCAP2-208	ENST00000491084	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SLX4	Q8IY92	1834 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PRELP	P51888	382 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PSMD1	Q99460	953 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	WDR90	Q96KV7	1748 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ANXA1	P04083	346 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TMC4	Q7Z404	712 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KRTCAP2-208	ENST00000491084	BBOX1	O75936	387 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084		E9PSI1	815 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	IL16	Q14005	1332 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	FZD9	O00144	591 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GPC2	Q8N158	579 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ABCC4	O15439	1325 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SCN4A	P35499	1836 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GRAP	Q13588	217 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	POTEC	B2RU33	542 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21

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