RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ERFE	Q4G0M1	354 aa		22.4	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		22.4	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		22.4	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		22.4	■■□□□ 1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP98	P52948	1817 aa		22.39	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM177B	A6PVY3	158 aa		22.39	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	22.39	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	GPT	P24298	496 aa		22.39	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		22.39	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	22.39	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NLRP3	Q96P20	1036 aa		22.39	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SLX4	Q8IY92	1834 aa		22.38	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		22.38	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	22.38	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	22.38	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	22.38	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC184	Q52MB2	194 aa		22.38	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		22.38	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	22.38	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		22.38	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		22.38	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT24	Q2M2I5	525 aa		22.37	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	22.37	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	22.37	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMD1	Q99460	953 aa		22.37	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		22.37	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCC12	Q96J65	1359 aa		22.37	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	IL16	Q14005	1332 aa		22.36	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NLRP10	Q86W26	655 aa		22.36	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	22.36	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CCER2	I3L3R5	266 aa		22.35	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ANXA1	P04083	346 aa		22.35	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	22.35	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RRAGC	Q9HB90	399 aa		22.35	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NECTIN2	Q92692	538 aa		22.34	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS33B	Q9H267	617 aa		22.34	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	APLP1	P51693	650 aa		22.33	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		22.33	■■□□□ 1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		22.32	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	BBOX1	O75936	387 aa		22.32	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	22.32	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		22.32	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	WWC1	Q8IX03	1113 aa		22.32	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		22.32	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SNED1	Q8TER0	1413 aa		22.31	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TMC4	Q7Z404	712 aa		22.31	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		22.31	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	22.31	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	22.3	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	22.3	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR63	Q8IWG1	891 aa		22.29	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP350	Q5VT06	3117 aa		22.29	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA2	Q08379	1002 aa		22.28	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNE4	Q8N205	404 aa		22.28	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		22.28	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		22.28	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		22.27	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	POTEC	B2RU33	542 aa		22.27	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	FZD9	O00144	591 aa		22.27	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	22.27	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	22.27	■■□□□ 1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR90	Q96KV7	1748 aa		22.26	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	22.26	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	22.26	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	JDP2	Q8WYK2	163 aa		22.26	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		22.25	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	22.25	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		22.25	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SP8	Q8IXZ3	490 aa		22.25	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		22.25	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		22.25	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	22.25	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	22.25	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	22.23	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GRAP	Q13588	217 aa		22.23	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MIER1	Q8N108	512 aa		22.23	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	22.23	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCC4	O15439	1325 aa		22.23	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	22.22	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	22.22	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OLFM4	Q6UX06	510 aa		22.22	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GPC2	Q8N158	579 aa		22.22	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	22.22	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	STK31	Q9BXU1	1019 aa		22.22	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	22.22	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		22.22	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	22.21	■■□□□ 1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	22.2	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPYL6	Q8N831	410 aa		22.2	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		22.19	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	22.19	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	HTRA3	P83110	453 aa		22.19	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	KSR2	Q6VAB6	950 aa		22.19	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		22.19	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM89A	Q96GI7	184 aa		22.19	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	22.18	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	22.18	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	22.18	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	22.18	■■□□□ 1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CHADL	Q6NUI6	762 aa		22.17	■■□□□ 1.14

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