RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 POTECB2RU33 542 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 NFKBIEO00221 500 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 STYK1Q6J9G0 422 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 PARP10Q53GL7 1025 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 MASTLQ96GX5 879 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 HYPKQ9NX55 129 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCC12Q96J65 1359 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 SLX4Q8IY92 1834 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 SUSD4Q5VX71 490 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 CNKSR1Q969H4 720 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 NTSR2O95665 410 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR63Q8IWG1 891 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 NPR1P16066 1061 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 ERFEQ4G0M1 354 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 TCIRG1Q13488 830 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPYL6Q8N831 410 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 CRY2Q49AN0 593 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 C21orf2O43822 256 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 POTEIP0CG38 1075 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 POTEJP0CG39 1038 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 NLRP10Q86W26 655 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGA2Q08379 1002 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 SOGA3Q5TF21 947 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 CCER2I3L3R5 266 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 CACNA1FO60840 1977 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC10A5Q5PT55 438 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 STK31Q9BXU1 1019 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 LAMB2P55268 1798 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ALDH1B1P30837 517 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 LTBP3Q9NS15 1303 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 CHADLQ6NUI6 762 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 NLRP3Q96P20 1036 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF521Q96K83 1311 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC93Q567U6 631 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXN1O15353 648 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 CRAMP1Q96RY5 1269 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 CREBZFQ9NS37 354 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 VAMP4O75379 141 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 SYNE4Q8N205 404 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC4A2P04920 1241 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-205ENST00000444916 OLFM4Q6UX06 510 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 KSR2Q6VAB6 950 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 RTKN2Q8IZC4 609 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF428Q96B54 188 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM89AQ96GI7 184 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 MYD88Q99836 296 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 SNED1Q8TER0 1413 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 G2E3Q7L622 706 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-205ENST00000444916 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.12■□□□□ 0.49
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