RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 EPHX2P34913 555 aa21.86■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 SNED1Q8TER0 1413 aa21.86■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.85■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.85■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.84■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 PROSER3Q2NL68 480 aa21.84■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.84■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 NTSR2O95665 410 aa21.83■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 RIPK4P57078 832 aa21.83■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 PDIA6Q15084 440 aa21.83■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 NECTIN2Q92692 538 aa21.83■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 ZNF428Q96B54 188 aa21.83■■□□□ 1.09
VARS-216ENST00000428445 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.82■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 PSMD1Q99460 953 aa21.82■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 CNTNAP1P78357 1384 aa21.82■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.81■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 VEGFBP49765 207 aa21.81■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.084e-8■■■■■ 28.6
VARS-216ENST00000428445 CNTROBQ8N137 903 aa21.81■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 JDP2Q8WYK2 163 aa21.81■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.81■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 FOXN1O15353 648 aa21.8■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 GPC2Q8N158 579 aa21.8■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 LTBP1Q14766 1721 aa21.8■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.79■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 EPS15P42566 896 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 KRT24Q2M2I5 525 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 NEUROD2Q15784 382 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
VARS-216ENST00000428445 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 SCNN1DP51172 638 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 COPS6Q7L5N1 327 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 NLRP3Q96P20 1036 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 AOC3Q16853 763 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 ERBB4Q15303 1308 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 TAF1P21675 1872 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 ABCC4O15439 1325 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 PPIP5K2O43314 1243 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 PARP10Q53GL7 1025 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 LAMB2P55268 1798 aa21.72■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 NIM1KQ8IY84 436 aa21.72■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.72■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 TRAF5O00463 557 aa21.71■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 NLRP10Q86W26 655 aa21.71■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
VARS-216ENST00000428445 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 RASSF10A6NK89 507 aa21.69■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 LBX1P52954 281 aa21.69■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 CXCL9Q07325 125 aa21.69■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 RALBP1Q15311 655 aa21.69■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.69■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 WBP1LQ9NX94 342 aa21.69■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.69■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 TCIRG1Q13488 830 aa21.68■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 AIDAQ96BJ3 306 aa21.68■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.68■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 CHL1O00533 1208 aa21.67■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 GRM1Q13255 1194 aa21.67■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 CST9Q5W186 159 aa21.67■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.67■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.67■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 SP8Q8IXZ3 490 aa21.66■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 MPNDQ8N594 471 aa21.66■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.66■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 BBOX1O75936 387 aa21.65■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 RAD17O75943 681 aa21.65■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.65■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.65■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
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