RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411660.1

RPS3AP25-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP25, Length 793 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP25-201ENST00000411660 C14orf37Q86TY3 774 aa10.17□□□□□ -0.78
RPS3AP25-201ENST00000411660 SIN3BO75182 1162 aa10.16□□□□□ -0.78
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPEM2Q0P670 501 aa10.16□□□□□ -0.78
RPS3AP25-201ENST00000411660 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.16□□□□□ -0.78
RPS3AP25-201ENST00000411660 PODNQ7Z5L7 613 aa10.16□□□□□ -0.78
RPS3AP25-201ENST00000411660 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.15□□□□□ -0.78
RPS3AP25-201ENST00000411660 VTI1AQ96AJ9 217 aa10.15□□□□□ -0.78
RPS3AP25-201ENST00000411660 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
RPS3AP25-201ENST00000411660 KLK14Q9P0G3 267 aa10.15□□□□□ -0.78
RPS3AP25-201ENST00000411660 NISCHQ9Y2I1 1504 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRMT3O60678 531 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 DGKZQ13574 1117 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 LRFN2Q9ULH4 789 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 MKL2Q9ULH7 1088 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 ELOA3BQ3SY89 546 aa10.13□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 CHSY3Q70JA7 882 aa10.13□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 ELOA3Q8NG57 546 aa10.13□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 TNFRSF25Q93038 417 aa10.13□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 AMPD1P23109 780 aa10.12□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 INPP5BP32019 993 aa10.12□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 DGKGP49619 791 aa10.12□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 COL26A1Q96A83 441 aa10.12□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 RRAGCQ9HB90 399 aa10.12□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLAIN2Q9P270 581 aa10.12□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 COX20Q5RI15 118 aa10.11□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.11□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 GSX2Q9BZM3 304 aa10.11□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 EFCC1Q9HA90 598 aa10.11□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 MICAL2O94851 1124 aa10.1□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 IDH3AP50213 366 aa10.1□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 NEUROD1Q13562 356 aa10.1□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 DCAF5Q96JK2 942 aa10.1□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 IFT43Q96FT9 208 aa10.09□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.09□□□□□ -0.79
RPS3AP25-201ENST00000411660 OPLAHO14841 1288 aa10.08□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 CAPN12Q6ZSI9 719 aa10.08□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 SAP130Q9H0E3 1048 aa10.08□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 ALAS2P22557 587 aa10.07□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 COL8A1P27658 744 aa10.07□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 ARSDP51689 593 aa10.07□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 CCINQ13939 588 aa10.07□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 BHMTQ93088 406 aa10.07□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 SUV39H2Q9H5I1 410 aa10.07□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 STARD13Q9Y3M8 1113 aa10.07□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 GNB5O14775 395 aa10.06□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 PIK3R2O00459 728 aa10.05□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 EPB42P16452 691 aa10.05□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 C16orf46Q6P387 395 aa10.05□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 ADH7P40394 386 aa10.04□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 TNFRSF10BO14763 440 aa10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 ITGB2P05107 769 aa10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 ATP2B4P23634 1241 aa10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM26DQ5JW98 314 aa10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 TREML1Q86YW5 311 aa10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 MKNK1Q9BUB5 465 aa10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RPS3AP25-201ENST00000411660 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.02□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 MICALL1Q8N3F8 863 aa10.02□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRIM11Q96F44 468 aa10.02□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRDM6Q9NQX0 595 aa10.02□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 KRBA1A5PL33 1030 aa10.01□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 MAP3K6O95382 1288 aa10.01□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 EGFRP00533 1210 aa10.01□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 NFKB1P19838 968 aa10.01□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa10.01□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZFATQ9P243 1243 aa10.01□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 ALBP02768 609 aa10□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 PNMA5Q96PV4 448 aa10□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 KCNMB2Q9Y691 235 aa10□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 M0R082 166 aa9.99□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 IGHA1P01876 353 aa9.99□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.99□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.99□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP20Q9Y2K6 914 aa9.99□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 PLVAPQ9BX97 442 aa9.98□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 SEPT3Q9UH03 358 aa9.98□□□□□ -0.81
RPS3AP25-201ENST00000411660 SASH3O75995 380 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms