RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-55P-201ENST00000411092 SIN3BO75182 1162 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALAS2P22557 587 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 TYRO3Q06418 890 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRIM11Q96F44 468 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 MDFIQ99750 246 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCNH4Q9UQ05 1017 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCNQ4P56696 695 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 NEUROD1Q13562 356 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 TNFRSF25Q93038 417 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGFBP4P22692 258 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHRNA4P43681 627 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 HIF1AQ16665 826 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 CDCA8Q53HL2 280 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARXQ96QS3 562 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLVAPQ9BX97 442 aa5.56□□□□□ -1.52
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RNU6-55P-201ENST00000411092 ITGB7P26010 798 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADH7P40394 386 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 RTN1Q16799 776 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 CD163Q86VB7 1156 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 BHMTQ93088 406 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.55□□□□□ -1.52
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RNU6-55P-201ENST00000411092 RFX1P22670 979 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 BCS1LQ9Y276 419 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 WEE1P30291 646 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 IER5Q5VY09 327 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 Q8N3U1 123 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM200AQ8TCP9 573 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGFLR1Q9H665 355 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 KLK14Q9P0G3 267 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-55P-201ENST00000411092 FOXO3O43524 673 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 DGKZQ13574 1117 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 GSX2Q9BZM3 304 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
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RNU6-55P-201ENST00000411092 CCINQ13939 588 aa5.51□□□□□ -1.53
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RNU6-55P-201ENST00000411092 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.51□□□□□ -1.53
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RNU6-55P-201ENST00000411092 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
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RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM229AH3BQW9 127 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 NID1P14543 1247 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 EPB42P16452 691 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 DOC2BQ14184 412 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 EFCC1Q9HA90 598 aa5.5□□□□□ -1.53
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RNU6-55P-201ENST00000411092 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 LILRB5O75023 590 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 NFKB1P19838 968 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 INPP5BP32019 993 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 GATA4P43694 442 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 NUDT8Q8WV74 236 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 MYO19Q96H55 970 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRIMPOLQ96LW4 560 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.49□□□□□ -1.53
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RNU6-55P-201ENST00000411092 MICAL2O94851 1124 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 APBA3O96018 575 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARSDP51689 593 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRT25Q7Z3Z0 450 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRMT3O60678 531 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 GRIK4Q16099 956 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-55P-201ENST00000411092 SWI5Q1ZZU3 235 aa5.47□□□□□ -1.53
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