RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 RGL2O15211 777 aa22.47■■□□□ 1.19
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SH3BP5-203ENST00000408919 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 MSH5O43196 834 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 UTYO14607 1347 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
SH3BP5-203ENST00000408919 CASP7P55210 303 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 SUSD4Q5VX71 490 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 FAM177BA6PVY3 158 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 GNAI3P08754 354 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 SYNE4Q8N205 404 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 H7C1W4 665 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 NFIXQ14938 502 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 FAM89AQ96GI7 184 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 KAZALD1Q96I82 304 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 PARP10Q53GL7 1025 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 SUCLG2Q96I99 432 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 SETDB2Q96T68 719 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 NTSR2O95665 410 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 GNAI2P04899 355 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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SH3BP5-203ENST00000408919 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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SH3BP5-203ENST00000408919 AAMPQ13685 434 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 MYH3P11055 1940 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 CASZ1Q86V15 1759 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 MSL1Q68DK7 614 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-203ENST00000408919 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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SH3BP5-203ENST00000408919 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 LAMB2P55268 1798 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 CEP85Q6P2H3 762 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.36■■□□□ 1.17
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SH3BP5-203ENST00000408919 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCC12Q96J65 1359 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.33■■□□□ 1.17
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SH3BP5-203ENST00000408919 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5-203ENST00000408919 IGHDP01880 384 aa22.32■■□□□ 1.16
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SH3BP5-203ENST00000408919 MMP10P09238 476 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 NYXQ9GZU5 481 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 ATP8B2P98198 1209 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 MTX1Q13505 466 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 CNBD1Q8NA66 436 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 SRGAP3O43295 1099 aa22.28■■□□□ 1.16
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SH3BP5-203ENST00000408919 ZBTB7AO95365 584 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 TAF1P21675 1872 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 CTSWP56202 376 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 NPHP1O15259 732 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 CSF1RP07333 972 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 SSH3Q8TE77 659 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP5-203ENST00000408919 POLA2Q14181 598 aa22.26■■□□□ 1.15
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