RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 FAM161AQ3B820 660 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 GPTP24298 496 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 FOXO4P98177 505 aa25.17■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 C8orf34Q49A92 452 aa25.17■■□□□ 1.62
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HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.15■■□□□ 1.62
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HDDC3-202ENST00000394272 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 SCN7AQ01118 1682 aa25.15■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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HDDC3-202ENST00000394272 RGL2O15211 777 aa25.13■■□□□ 1.61
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HDDC3-202ENST00000394272 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.13■■□□□ 1.61
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HDDC3-202ENST00000394272 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.13■■□□□ 1.61
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HDDC3-202ENST00000394272 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.12■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.12■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 FAM89AQ96GI7 184 aa25.12■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.11■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 COPRSQ9NQ92 184 aa25.11■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.11■■□□□ 1.61
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HDDC3-202ENST00000394272 C4AP0C0L4 1744 aa25.1■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.09■■□□□ 1.61
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HDDC3-202ENST00000394272 PARP10Q53GL7 1025 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 SMIM5Q71RC9 77 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.09■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 NARFQ9UHQ1 456 aa25.09■■□□□ 1.61
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HDDC3-202ENST00000394272 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.08■■□□□ 1.61
HDDC3-202ENST00000394272 SYNE4Q8N205 404 aa25.07■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 BCL11AQ9H165 835 aa25.07■■□□□ 1.6
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HDDC3-202ENST00000394272 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.06■■□□□ 1.6
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HDDC3-202ENST00000394272 TXNRD1Q16881 649 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 TTC22Q5TAA0 569 aa25.04■■□□□ 1.6
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HDDC3-202ENST00000394272 SIL1Q9H173 461 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.04■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 LAMB2P55268 1798 aa25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.03■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.03■■□□□ 1.6
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HDDC3-202ENST00000394272 NTSR2O95665 410 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 MX1P20591 662 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 STAP2Q9UGK3 403 aa25.02■■□□□ 1.6
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HDDC3-202ENST00000394272 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 ADRA2BP18089 450 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.02■■□□□ 1.6
HDDC3-202ENST00000394272 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.01■■□□□ 1.6
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HDDC3-202ENST00000394272 ZPR1O75312 459 aa25.01■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 APBA3O96018 575 aa25.01■■□□□ 1.59
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HDDC3-202ENST00000394272 TTLL11Q8NHH1 800 aa25■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.99■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.99■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 AOX1Q06278 1338 aa24.99■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 PHF14O94880 888 aa24.98■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 RFC4P35249 363 aa24.98■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.98■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 FAM177BA6PVY3 158 aa24.98■■□□□ 1.59
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