RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 KIFC2Q96AC6 838 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 SENP2Q9HC62 589 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 POTECB2RU33 542 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 EHHADHQ08426 723 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-205ENST00000391970 EFHC2Q5JST6 749 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM47Q96LD4 638 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 USP20Q9Y2K6 914 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-205ENST00000391970 A6NHS1 94 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 E9PSI1 815 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 THBS1P07996 1170 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 EPB42P16452 691 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-205ENST00000391970 NIF3L1Q9GZT8 377 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-205ENST00000391970 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-205ENST00000391970 MAPK8P45983 427 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRC-205ENST00000391970 BRD7Q9NPI1 651 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 UBAP1LF5GYI3 381 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 H7C1W4 665 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 EFSO43281 561 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 CSRNP1Q96S65 589 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-205ENST00000391970 SETDB2Q96T68 719 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-205ENST00000391970 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-205ENST00000391970 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 VAMP1P23763 118 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 NLRP13Q86W25 1043 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 FBF1Q8TES7 1133 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-205ENST00000391970 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-205ENST00000391970 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.22□□□□□ -1.57
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