RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390935.1

RNA5SP18-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 18, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP18, Length 121 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP18-201ENST00000390935 IFT57Q9NWB7 429 aa10.09□□□□□ -0.79
RNA5SP18-201ENST00000390935 LTBP3Q9NS15 1303 aa10.08□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 GNAI1P63096 354 aa10.08□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 TCIRG1Q13488 830 aa10.08□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 PARP10Q53GL7 1025 aa10.08□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 CCDC93Q567U6 631 aa10.08□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 SYNE4Q8N205 404 aa10.08□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 ANP32CO43423 234 aa10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLC10A5Q5PT55 438 aa10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 NLRP10Q86W26 655 aa10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 MRS2Q9HD23 443 aa10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 LAMB2P55268 1798 aa10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 POTECB2RU33 542 aa10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLC51AQ86UW1 340 aa10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 PLBD2Q8NHP8 589 aa10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 NLRP3Q96P20 1036 aa10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 HYPKQ9NX55 129 aa10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 TAF1P21675 1872 aa10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 RIC1Q4ADV7 1423 aa10.06□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.05□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 DDNO94850 711 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 WWC1Q8IX03 1113 aa10.05□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 TSPYL6Q8N831 410 aa10.05□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 CRAMP1Q96RY5 1269 aa10.05□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 WDR90Q96KV7 1748 aa10.04□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 CCDC27Q2M243 656 aa10.04□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.04□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 SNED1Q8TER0 1413 aa10.04□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 SH3TC1Q8TE82 1336 aa10.04□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 APLP1P51693 650 aa10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 FSTL1Q12841 308 aa10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM89AQ96GI7 184 aa10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 PSMD1Q99460 953 aa10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 ABCC4O15439 1325 aa10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF541Q9H0D2 1346 aa10.03□□□□□ -0.8
RNA5SP18-201ENST00000390935 HTRA3P83110 453 aa10.02□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 SMC1BQ8NDV3 1235 aa10.02□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa10.02□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 FZD9O00144 591 aa10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 BBOX1O75936 387 aa10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 GOLGA2Q08379 1002 aa10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM9BQ8IZU0 186 aa10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 MYD88Q99836 296 aa10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 COL4A5P29400 1685 aa10.01□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 SCN4AP35499 1836 aa10□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 POTEIP0CG38 1075 aa10□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 POTEJP0CG39 1038 aa10□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 SP8Q8IXZ3 490 aa10□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 JDP2Q8WYK2 163 aa10□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 GRAPQ13588 217 aa9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 G2E3Q7L622 706 aa9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 IL16Q14005 1332 aa9.99□□□□□ -0.81
RNA5SP18-201ENST00000390935 PCNTO95613 3336 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms