RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.57■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 RSPH14Q9UHP6 348 aa25.57■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF10O15013 1369 aa25.57■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 CNTROBQ8N137 903 aa25.57■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.56■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 ST5P78524 1137 aa25.55■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.55■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 BICD2Q8TD16 824 aa25.55■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
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OPN3-201ENST00000366554 SMARCE1Q969G3 411 aa25.55■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 CRB1P82279 1406 aa25.55■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 NOP2P46087 812 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 GSDMDP57764 484 aa25.54■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.54■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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OPN3-201ENST00000366554 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 GGT6Q6P531 493 aa25.53■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 NME9Q86XW9 330 aa25.53■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 RGS22Q8NE09 1264 aa25.53■■□□□ 1.68
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OPN3-201ENST00000366554 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.53■■□□□ 1.68
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OPN3-201ENST00000366554 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
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OPN3-201ENST00000366554 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.52■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 MYO1CO00159 1063 aa25.52■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 RAB11FIP3O75154 756 aa25.52■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 STX1AQ16623 288 aa25.52■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 ADCY9O60503 1353 aa25.51■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 TUBB4AP04350 444 aa25.51■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.51■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN26Q16670 478 aa25.51■■□□□ 1.67
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OPN3-201ENST00000366554 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.51■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 NECTIN1Q15223 517 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 NBPF11Q86T75 865 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 BECN2A8MW95 431 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 ATG3Q9NT62 314 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 KCNJ6P48051 423 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 IDI1Q13907 227 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 UBXN4Q92575 508 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.5■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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OPN3-201ENST00000366554 GPS2Q13227 327 aa25.49■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.48■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 FLIIQ13045 1269 aa25.48■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 USP44Q9H0E7 712 aa25.48■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.48■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 CTAGE5O15320 804 aa25.48■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 CASQ1P31415 396 aa25.47■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.47■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 SASH3O75995 380 aa25.47■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 C10orf67Q8IYJ2 551 aa25.47■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.47■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D8O95759 1140 aa25.46■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 OAS2P29728 719 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
OPN3-201ENST00000366554 TADA3O75528 432 aa25.45■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 POLA2Q14181 598 aa25.45■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.45■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 STK31Q9BXU1 1019 aa25.45■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 MAP3K5Q99683 1374 aa25.44■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.44■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 CTR9Q6PD62 1173 aa25.44■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB9Q96C00 473 aa25.44■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.44■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 CHD1O14646 1710 aa25.44■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
OPN3-201ENST00000366554 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
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