RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 NAA25Q14CX7 972 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM7Q9C029 511 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 STX6O43752 255 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM177BA6PVY3 158 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 PPFIBP2Q8ND30 876 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 PIBF1Q8WXW3 757 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 NEBLO76041 1014 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 SCLT1Q96NL6 688 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 VAV2P52735 878 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 SAMD15Q9P1V8 674 aa12.15□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 AK9Q5TCS8 1911 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP4R3AQ6IN85 833 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL10Q6JEL2 608 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 ZMYM3Q14202 1370 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTN2P35609 894 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC14Q49A88 953 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 ERO1AQ96HE7 468 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 GDPD2Q9HCC8 539 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 TOP2BQ02880 1626 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT83P78385 493 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 SMC5Q8IY18 1101 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 RASSF2P50749 326 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 PAF1Q8N7H5 531 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 LRCH2Q5VUJ6 765 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 THEGQ9P2T0 379 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 TRPC3Q13507 836 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 UBAC1Q9BSL1 405 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 GIMAP6Q6P9H5 292 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 MAATS1Q7Z4T9 603 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CTAGE15A4D2H0 777 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CTAGE8P0CG41 777 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R2P41236 205 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 ANO6Q4KMQ2 910 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CTAGE6Q86UF2 777 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CTAGE4Q8IX94 777 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAI1Q9UI46 699 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF14Q15058 1648 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 PPFIA1Q13136 1202 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC186Q7Z3E2 898 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA0753Q2KHM9 967 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 9.5
SH3BP2-201ENST00000356331 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAF1Q13077 416 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 HOMER2Q9NSB8 354 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 PPFIA2O75334 1257 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT86O43790 486 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 FERMT3Q86UX7 667 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM76AQ8TAV0 307 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 STMN2Q93045 179 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 HYPKQ9NX55 129 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 STRN4Q9NRL3 753 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNG4Q8TDN1 519 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM14Q14142 442 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CIB2O75838 187 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 USP48Q86UV5 1035 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC114Q96M63 670 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF365Q70YC5 407 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1W2PRG0 241 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHDP01880 384 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D5Q92609 795 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms