RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 SCN7AQ01118 1682 aa22.61■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.61■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 COL15A1P39059 1388 aa22.61■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.6■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.59■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.59■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 ZPR1O75312 459 aa22.58■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 GNAI2P04899 355 aa22.58■■□□□ 1.21
SYNE4-201ENST00000324444 NUP98P52948 1817 aa22.58■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 A0A087WZG4 1122 aa22.57■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.57■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.57■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.56■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.56■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.56■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.56■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 HMMRO75330 724 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 TGFB2P61812 414 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 DDR1Q08345 913 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 MEIS3Q99687 375 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 NARFQ9UHQ1 456 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 A0A0G2JLW4 131 aa22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 RGL2O15211 777 aa22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 MYD88Q99836 296 aa22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 USP44Q9H0E7 712 aa22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.51■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.51■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 CAMTA2O94983 1202 aa22.51■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.51■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.51■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 GRM8O00222 908 aa22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 DPEP1P16444 411 aa22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 TM4SF1P30408 202 aa22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 GCC1Q96CN9 775 aa22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 UTYO14607 1347 aa22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 TCIRG1Q13488 830 aa22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 IGKV5-2P06315 115 aa22.49■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 GCKRQ14397 625 aa22.49■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 NFIXQ14938 502 aa22.49■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.49■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.49■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 IGHDP01880 384 aa22.48■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 HLFQ16534 295 aa22.48■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 BCS1LQ9Y276 419 aa22.48■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 CEP85Q6P2H3 762 aa22.47■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.47■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.46■■□□□ 1.19
SYNE4-201ENST00000324444 ATP8B2P98198 1209 aa22.45■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.45■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 KCNA3P22001 575 aa22.44■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 SMC5Q8IY18 1101 aa22.44■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.43■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.42■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 SERPINB2P05120 415 aa22.42■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 CHRNA5P30532 468 aa22.42■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.42■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 PIM2Q9P1W9 311 aa22.42■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 MTX1Q13505 466 aa22.41■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 PARP10Q53GL7 1025 aa22.41■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.41■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 H7C1W4 665 aa22.4■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.4■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.4■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 DCTPP1Q9H773 170 aa22.4■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.39■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.39■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.39■■□□□ 1.18
SYNE4-201ENST00000324444 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 NLRP10Q86W26 655 aa22.38■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.38■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 SSH3Q8TE77 659 aa22.38■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 LAMB2P55268 1798 aa22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 GPTP24298 496 aa22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 CASP7P55210 303 aa22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.37■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.36■■□□□ 1.17
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