RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.84■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.84■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NHSQ6T4R5 1651 aa26.83■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.83■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SASH1O94885 1247 aa26.83■■□□□ 1.89
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP6V1AP38606 617 aa26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATRNO75882 1429 aa26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A0G2JS52 829 aa26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNQ2O43526 872 aa26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.8■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AFF2P51816 1311 aa26.8■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITPK1Q13572 414 aa26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BTAF1O14981 1849 aa26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BECN1Q14457 450 aa26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HLFQ16534 295 aa26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPATCH3Q96I76 525 aa26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYT1Q01538 1121 aa26.77■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIL1Q9H173 461 aa26.77■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERC2O15083 957 aa26.76■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AACSQ86V21 672 aa26.76■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRP10Q86W26 655 aa26.76■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.76■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.76■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SBF2Q86WG5 1849 aa26.75■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.75■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYH3P11055 1940 aa26.75■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARXQ96QS3 562 aa26.74■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 REC8O95072 547 aa26.74■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RILPL2Q969X0 211 aa26.73■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCORQ6W2J9 1755 aa26.73■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHMLP26374 656 aa26.72■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP26Q9BXU7 913 aa26.72■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.72■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.71■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC4A3P48751 1232 aa26.71■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNTROBQ8N137 903 aa26.71■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF2CQ99661 725 aa26.71■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.71■■□□□ 1.87
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM89AQ96GI7 184 aa26.7■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.7■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LY75O60449 1722 aa26.69■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSF1RP07333 972 aa26.69■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPTP24298 496 aa26.69■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CIAO1O76071 339 aa26.69■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO3Q9UK99 471 aa26.69■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.68■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFCP2Q12800 502 aa26.68■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNNI3KQ59H18 835 aa26.68■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.68■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.68■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.68■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.67■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAMTA2O94983 1202 aa26.67■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR108Q9NPR9 543 aa26.66■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.66■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.66■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EYA2O00167 538 aa26.65■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.65■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX21Q969T3 373 aa26.65■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AK7Q96M32 723 aa26.64■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.64■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGL2O15211 777 aa26.63■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.63■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAMB2P55268 1798 aa26.63■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCN7AQ01118 1682 aa26.63■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARP10Q53GL7 1025 aa26.63■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EVI5LQ96CN4 794 aa26.63■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTSWP56202 376 aa26.61■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE8AO60658 829 aa26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms