RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.23■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.23■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.23■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 FAM227BQ96M60 508 aa22.22■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 KCNJ4P48050 445 aa22.22■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 LRMPQ12912 555 aa22.22■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 DACT1Q9NYF0 836 aa22.22■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.21■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.21■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD7Q92527 254 aa22.21■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 TNMDQ9H2S6 317 aa22.21■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 DIP2AQ14689 1571 aa22.21■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 ADCY9O60503 1353 aa22.2■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 ELP1O95163 1332 aa22.2■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 KCNQ3O43525 872 aa22.2■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 CBX8Q9HC52 389 aa22.2■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.2■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 EVI5LQ96CN4 794 aa22.19■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 LGR6Q9HBX8 967 aa22.19■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 KCNA6P17658 529 aa22.19■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 AACSQ86V21 672 aa22.19■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 GPATCH3Q96I76 525 aa22.19■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.18■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 SLC27A2O14975 620 aa22.18■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 MTX1Q13505 466 aa22.18■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 DRC7Q8IY82 874 aa22.18■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 MAP4K1Q92918 833 aa22.18■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.18■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 SPATA32Q96LK8 384 aa22.17■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.17■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 TRIM5Q9C035 493 aa22.16■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 PDCP20941 246 aa22.16■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.15■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 STK3Q13188 491 aa22.15■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 A0A0D9SFI3 127 aa22.15■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.15■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 NR1I2O75469 434 aa22.14■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 PSMA5P28066 241 aa22.14■■□□□ 1.14
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF75DP51815 510 aa22.14■■□□□ 1.14
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CNIH3-201ENST00000272133 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.14■■□□□ 1.13
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CNIH3-201ENST00000272133 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.14■■□□□ 1.13
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CNIH3-201ENST00000272133 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.13■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 HOXB7P09629 217 aa22.13■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.13■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.13■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 RPS6KB1P23443 525 aa22.12■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF165P49910 485 aa22.12■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 ABTB2Q8N961 1025 aa22.12■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 PGBD1Q96JS3 809 aa22.12■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 SASH1O94885 1247 aa22.11■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 BICD2Q8TD16 824 aa22.11■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 TNNT1P13805 278 aa22.11■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 PROSER3Q2NL68 480 aa22.11■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.11■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD1Q15327 319 aa22.1■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 FSD1Q9BTV5 496 aa22.1■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.1■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 BTBD11A6QL63 1104 aa22.1■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.1■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 SMTNL1A8MU46 457 aa22.09■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 HIP1O00291 1037 aa22.09■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 JAK2O60674 1132 aa22.09■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.09■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 RNF20Q5VTR2 975 aa22.09■■□□□ 1.13
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.09■■□□□ 1.13
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