RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 NUP98P52948 1817 aa26.05■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 BTAF1O14981 1849 aa26.04■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 FOXO4P98177 505 aa26.04■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.04■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 COL15A1P39059 1388 aa26.04■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 EP400Q96L91 3159 aa26.03■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 SASH1O94885 1247 aa26.02■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.02■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.76
RFXAP-201ENST00000255476 CDC45O75419 566 aa26.01■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 FAM89AQ96GI7 184 aa26.01■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 NHSQ6T4R5 1651 aa26.01■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 LINC00116Q8NCU8 138 aa26■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 STAP2Q9UGK3 403 aa26■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 SYNE4Q8N205 404 aa26■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 RREB1Q92766 1687 aa26■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 SBF2Q86WG5 1849 aa25.99■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.99■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 NLRP10Q86W26 655 aa25.99■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.99■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 COPRSQ9NQ92 184 aa25.98■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.97■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.97■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.95■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 SMIM5Q71RC9 77 aa25.95■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.95■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.95■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 AACSQ86V21 672 aa25.94■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.94■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.93■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.93■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 CAMTA2O94983 1202 aa25.93■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.93■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 RILPL2Q969X0 211 aa25.93■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
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RFXAP-201ENST00000255476 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
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RFXAP-201ENST00000255476 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 FAM177BA6PVY3 158 aa25.9■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 SLC4A3P48751 1232 aa25.9■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 TFCP2Q12800 502 aa25.9■■□□□ 1.74
RFXAP-201ENST00000255476 AK9Q5TCS8 1911 aa25.88■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.88■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 SUSD4Q5VX71 490 aa25.87■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.87■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.87■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.87■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 LY75O60449 1722 aa25.87■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.87■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC24Q50LG9 513 aa25.87■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.87■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.86■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 MYH3P11055 1940 aa25.86■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 CASC1Q6TDU7 716 aa25.86■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 CSF1RP07333 972 aa25.85■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.85■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.85■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 TNNI3KQ59H18 835 aa25.84■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.84■■□□□ 1.73
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RFXAP-201ENST00000255476 GNPATO15228 680 aa25.83■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.83■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.83■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 GPATCH3Q96I76 525 aa25.83■■□□□ 1.73
RFXAP-201ENST00000255476 EYA2O00167 538 aa25.82■■□□□ 1.72
RFXAP-201ENST00000255476 ERC2O15083 957 aa25.82■■□□□ 1.72
RFXAP-201ENST00000255476 CHMLP26374 656 aa25.82■■□□□ 1.72
RFXAP-201ENST00000255476 CTSWP56202 376 aa25.82■■□□□ 1.72
RFXAP-201ENST00000255476 GREM2Q9H772 168 aa25.82■■□□□ 1.72
RFXAP-201ENST00000255476 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
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