RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.36■■□□□ 1.49
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VGF-201ENST00000249330 DDB1Q16531 1140 aa24.36■■□□□ 1.49
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VGF-201ENST00000249330 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
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VGF-201ENST00000249330 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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VGF-201ENST00000249330 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.32■■□□□ 1.48
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VGF-201ENST00000249330 BRD1O95696 1058 aa24.31■■□□□ 1.48
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VGF-201ENST00000249330 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.27■■□□□ 1.48
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VGF-201ENST00000249330 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
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VGF-201ENST00000249330 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.24■■□□□ 1.47
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VGF-201ENST00000249330 PHF14O94880 888 aa24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 STARD3NLO95772 234 aa24.23■■□□□ 1.47
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VGF-201ENST00000249330 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.23■■□□□ 1.47
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VGF-201ENST00000249330 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 PALD1Q9ULE6 856 aa24.22■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.21■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 KCNQ2O43526 872 aa24.21■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.21■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.21■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 CHMLP26374 656 aa24.2■■□□□ 1.47
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