RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217195.12

C20orf27-201, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C20orf27, Length 1,302 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-201ENST00000217195 MRS2Q9HD23 443 aa25.4■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.4■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 ABCC12Q96J65 1359 aa25.4■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.39■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 ANXA1P04083 346 aa25.39■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 KRT24Q2M2I5 525 aa25.39■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 SLX4Q8IY92 1834 aa25.39■■□□□ 1.66
C20orf27-201ENST00000217195 HSPA6P17066 643 aa25.38■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 NLRP3Q96P20 1036 aa25.38■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 TCIRG1Q13488 830 aa25.37■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.37■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.37■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 PRELPP51888 382 aa25.36■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.36■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.36■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.36■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 FSTL1Q12841 308 aa25.35■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 NLRP10Q86W26 655 aa25.35■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 RRAGCQ9HB90 399 aa25.35■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.33■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 CACNA1SQ13698 1873 aa25.33■■□□□ 1.65
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC184Q52MB2 194 aa25.33■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.33■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 IL16Q14005 1332 aa25.32■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 GOLGA2Q08379 1002 aa25.32■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.32■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 PSMD1Q99460 953 aa25.32■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 WWC1Q8IX03 1113 aa25.31■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 CEP350Q5VT06 3117 aa25.3■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 APLP1P51693 650 aa25.3■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.29■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.29■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.28■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.27■■□□□ 1.64
C20orf27-201ENST00000217195 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 BBOX1O75936 387 aa25.26■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 TMC4Q7Z404 712 aa25.26■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 JDP2Q8WYK2 163 aa25.26■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 WDR90Q96KV7 1748 aa25.26■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.25■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 SYNE4Q8N205 404 aa25.25■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.25■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 STK31Q9BXU1 1019 aa25.25■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 VPS33BQ9H267 617 aa25.25■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 SNED1Q8TER0 1413 aa25.24■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 WDR63Q8IWG1 891 aa25.24■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.23■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 ABCC4O15439 1325 aa25.22■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 OLFM4Q6UX06 510 aa25.22■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.22■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.22■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
C20orf27-201ENST00000217195 GRAPQ13588 217 aa25.2■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.2■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.19■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 FZD9O00144 591 aa25.19■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 SP8Q8IXZ3 490 aa25.19■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 FAM89AQ96GI7 184 aa25.18■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 GPC2Q8N158 579 aa25.17■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.17■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 TSPYL6Q8N831 410 aa25.17■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 POTECB2RU33 542 aa25.16■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.15■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 KSR2Q6VAB6 950 aa25.15■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 MYD88Q99836 296 aa25.15■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.14■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.14■■□□□ 1.62
C20orf27-201ENST00000217195 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.14■■□□□ 1.61
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