RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zranb3Q6NZP1 1069 aa26.93■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sp8Q8BMJ8 486 aa26.93■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cd22P35329 862 aa26.92■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tceanc2Q8R2M0 207 aa26.92■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Igbp1bQ9QZ29 343 aa26.92■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Evi5lH3BKQ3 813 aa26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GpkowQ56A08 488 aa26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Adora1Q60612 326 aa26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tns2Q8CGB6 1400 aa26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc66Q6NS45 935 aa26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tsr2Q8C8T8 191 aa26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mknk2Q8CDB0 459 aa26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wdr24Q8CFJ9 790 aa26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 InsrrQ9WTL4 1300 aa26.91■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa26.9■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tnks1bp1P58871 1720 aa26.89■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa26.89■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa26.89■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mst1rQ62190 1378 aa26.89■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem87bQ8BKU8 555 aa26.89■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PigbQ9JJQ0 542 aa26.89■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam50bQ9WTJ8 334 aa26.89■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Aox1O54754 1333 aa26.89■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Neurod6P48986 337 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gse1Q3U3C9 1213 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc39a6Q8C145 765 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp113Q8C689 439 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MypnQ5DTJ9 1315 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wnk3Q80XP9 1757 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Leo1Q5XJE5 667 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nap1l3Q794H2 544 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ripor2Q80U16 1078 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AceP09470 1312 aa26.88■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 FanccP50652 591 aa26.87■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DbnlQ62418 436 aa26.87■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Adcy5P84309 1262 aa26.87■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bach2P97303 839 aa26.87■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Asic4Q7TNS7 539 aa26.87■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26.86■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 NmiO35309 314 aa26.86■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ripk4Q9ERK0 786 aa26.86■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PdcQ9QW08 244 aa26.86■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hmg20bQ9Z104 317 aa26.86■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa26.86■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cfap73J3QPZ5 306 aa26.85■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Card10P58660 1021 aa26.85■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pknox2Q8BG99 474 aa26.85■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa26.85■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa26.84■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RubcnlQ3TD16 648 aa26.84■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q8C5K5 320 aa26.84■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cep57l1Q8VDS7 400 aa26.84■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cnnm3Q32NY4 713 aa26.84■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spata31d1bE9QA57 1361 aa26.83■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dhx38Q80X98 1228 aa26.83■■□□□ 1.89
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hvcn1Q3U2S8 269 aa26.82■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Soga3Q6NZL0 945 aa26.82■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DmtnQ9WV69 405 aa26.82■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa26.82■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CgnP59242 1191 aa26.82■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gnat3Q3V3I2 354 aa26.82■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ankle2Q6P1H6 964 aa26.81■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddx58Q6Q899 926 aa26.81■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nek11Q8C0Q4 628 aa26.81■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa26.81■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fkbp5Q64378 456 aa26.8■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa26.8■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Me3Q8BMF3 604 aa26.8■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AppP12023 770 aa26.79■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tubb6Q922F4 447 aa26.79■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 EzrP26040 586 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ssfa2Q922B9 1252 aa26.79■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mx2Q9WVP9 655 aa26.79■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vps54Q5SPW0 977 aa26.78■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Snx13Q6PHS6 957 aa26.78■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa26.78■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Efcab2Q9CQ46 164 aa26.78■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 LratQ9JI60 231 aa26.78■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc162pQ0VG85 912 aa26.77■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ctdnep1Q3TP92 244 aa26.77■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 ZwintQ9CQU5 252 aa26.77■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slit1Q80TR4 1531 aa26.77■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stat1P42225 749 aa26.77■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp25P57080 1055 aa26.77■■□□□ 1.88
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kank4Q6P9J5 1016 aa26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.4 ms