RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.51■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.51■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 OR2M5A3KFT3 312 aa20.5■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 SLC16A11Q8NCK7 471 aa20.5■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa20.5■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 TNFSF13O75888 250 aa20.49■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 SMPDL3BQ92485 455 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 FIG4Q92562 907 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 C16orf58Q96GQ5 468 aa20.49■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 C1orf50Q9BV19 199 aa20.49■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.49■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 TMEM114B3SHH9 223 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 GATSQ8NAP1 163 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 OR4C3Q8NH37 302 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 NINJ1Q92982 152 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 PINK1Q9BXM7 581 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 VDAC3Q9Y277 283 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 KCNK2O95069 426 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 MAPK1P28482 360 aa20.47■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 EMBQ6PCB8 327 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 HOMEZQ8IX15 550 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 NUDT8Q8WV74 236 aa20.47■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 NF1P21359 2839 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 ACANP16112 2415 aa20.46■□□□□ 0.87
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PPP4C-212ENST00000567828 ALG1L2C9J202 215 aa20.46■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 LINC01387J3KSC0 135 aa20.46■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 BPGMP07738 259 aa20.46■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 ALOX5P09917 674 aa20.46■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 LAMP1P11279 417 aa20.46■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 SERPINB5P36952 375 aa20.46■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 SIRPAP78324 504 aa20.46■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
PPP4C-212ENST00000567828 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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