RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 CLDN9O95484 217 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 THBDP07204 575 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 GSTA2P09210 222 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CT45A8P0DMV1 189 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CT45A9P0DMV2 189 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 DRD5P21918 477 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CD79BP40259 229 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEA4P43358 317 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PPICP45877 212 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 DIO3P55073 304 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CORO7P57737 925 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 SIRPAP78324 504 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 GAB1Q13480 694 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ACAP2Q15057 778 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS53Q2L4Q9 553 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CT45A2Q5DJT8 189 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 SGO1Q5FBB7 561 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 FRG2Q64ET8 278 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ENPP6Q6UWR7 440 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 COMMD6Q7Z4G1 85 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PIGTQ969N2 578 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 REPS1Q96D71 796 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PHF21BQ96EK2 531 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35A4Q96G79 324 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 SFXN2Q96NB2 322 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 COL21A1Q96P44 957 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 FRG2BQ96QU4 278 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ADOQ96SZ5 270 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CCL19Q99731 98 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 NTMT1Q9BV86 223 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 NDRG3Q9UGV2 375 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF225Q9UK10 706 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PCTPQ9UKL6 214 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 DSCAMO60469 2012 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 RTTNQ86VV8 2226 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 A0A096LPK6 155 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 C1orf226A1L170 272 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 REM1O75628 298 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL2O95198 593 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PLAUP00749 431 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PDYNP01213 254 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CHN1P15882 459 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 TSPAN8P19075 237 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CHMP24386 653 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 GRK2P25098 689 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 DPP4P27487 766 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 UGT2B10P36537 528 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PTH2RP49190 550 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PCYT1AP49585 367 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 MAPK12P53778 367 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PLTPP55058 493 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 GUSBP1Q15486 140 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC25Q86WR0 208 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 UBQLNLQ8IYU4 475 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 FADS6Q8N9I5 356 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 OR2M3Q8NG83 312 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 OR4F6Q8NGB9 312 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO25Q8TCJ0 367 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 KAT2AQ92830 837 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CAVIN3Q969G5 261 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL29Q96CT2 875 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PGM2Q96G03 612 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 VSTM2LQ96N03 204 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 FAM111AQ96PZ2 611 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 BTBD9Q96Q07 612 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 HBEGFQ99075 208 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 BDH2Q9BUT1 245 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 MED4Q9NPJ6 270 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 NFU1Q9UMS0 254 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 SLC12A4Q9UP95 1085 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CFL2Q9Y281 166 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms