RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CTBP1	Q13363	440 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	GAMT	Q14353	236 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CENPU	Q71F23	418 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	STARD8	Q92502	1023 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ARL5B	Q96KC2	179 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	PSMD9	O00233	223 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	BIRC5	O15392	142 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	C1orf105	O95561	183 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	C8G	P07360	202 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CYC1	P08574	325 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CD63	P08962	238 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	UROS	P10746	265 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	PRF1	P14222	555 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	PVR	P15151	417 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	FOLR1	P15328	257 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF3	P17036	446 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	MAG	P20916	626 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ELK3	P41970	407 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	MAGEA3	P43357	314 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ARSF	P54793	590 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	PRRX1	P54821	245 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	NME5	P56597	212 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ARPC4	P59998	168 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CYP4F2	P78329	520 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	OLR1	P78380	273 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CAV1	Q03135	178 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CDC20	Q12834	499 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	IL24	Q13007	206 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	CUL1	Q13616	776 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	FHL3	Q13643	280 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	RCN1	Q15293	331 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.38	□□□□□ -1.71

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