RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 EDN1P05305 212 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CHRNGP07510 517 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 GNAO1P09471 354 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 LCTP09848 1927 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CCDC159P0C7I6 412 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TRAPPC2P0DI81 140 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TRAPPC2BP0DI82 140 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ACP2P11117 423 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 GFAPP14136 432 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 IL1RNP18510 177 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 IMPDH1P20839 514 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 GPX3P22352 226 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CYP2F1P24903 491 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 HTR1EP28566 365 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 MC5RP33032 325 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SLC26A3P40879 764 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 OPRL1P41146 370 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ETV6P41212 452 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 GRIA1P42261 906 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TRPC1P48995 793 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 NPY2RP49146 381 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TSC2P49815 1807 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CXCR4P61073 352 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ZNF33AQ06730 810 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 RALGDSQ12967 914 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 HSPB3Q12988 150 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 FADDQ13158 208 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 DOCK1Q14185 1865 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 KLHL26Q53HC5 615 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 GLRA4Q5JXX5 417 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 GPR107Q5VW38 600 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SLC26A9Q7LBE3 791 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 STRADAQ7RTN6 431 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SMIM29Q86T20 159 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 IQCHQ86VS3 1027 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 DHFR2Q86XF0 187 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ELMOD1Q8N336 334 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CBR4Q8N4T8 237 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 RHOXF1Q8NHV9 184 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ANGPTL6Q8NI99 470 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 HTR3CQ8WXA8 447 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 NT5C3BQ969T7 300 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SLAMF9Q96A28 289 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 RMDN1Q96DB5 314 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CCDC126Q96EE4 140 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CDHR1Q96JP9 859 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 KIFC1Q9BW19 673 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TM9SF3Q9HD45 589 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PXMP2Q9NR77 195 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ZFP57Q9NU63 452 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 GDAP2Q9NXN4 497 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PKD2L2Q9NZM6 624 aa4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ILVBLA1L0T0 632 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 J3QRK9 145 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 K7ERI5 159 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UBXN8O00124 270 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 BMPR1BO00238 502 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NME4O00746 187 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MRASO14807 208 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UBDO15205 165 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 XPNPEP2O43895 674 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NOL3O60936 208 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SRP72O76094 671 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PTTG1O95997 202 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FYNP06241 537 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 HTR1AP08908 422 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SLC35E2BP0CK96 405 aa4.58□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PDGFRAP16234 1089 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms