RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 ITGAMP11215 1152 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 NQO1P15559 274 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 WT1P19544 449 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ATP6V1C1P21283 382 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ABCD3P28288 659 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 KDELR2P33947 212 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 SOX11P35716 441 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 KRT20P35900 424 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 CORO7P57737 925 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 FOXK2Q01167 660 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 TLE3Q04726 772 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 FUT5Q11128 374 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 TCTN3Q6NUS6 607 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 HPS6Q86YV9 775 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 AQP12AQ8IXF9 295 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 GALNT16Q8N428 558 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 BCORP1Q8N888 145 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 DOK4Q8TEW6 326 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 RNF138Q8WVD3 245 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 PSMF1Q92530 271 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 RAB8BQ92930 207 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 SLC35B4Q969S0 331 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 TMEM19Q96HH6 336 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 SGCZQ96LD1 299 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 GAL3ST4Q96RP7 486 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 LMF1Q96S06 567 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 YIPF4Q9BSR8 244 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 TRIM15Q9C019 465 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 RNF32Q9H0A6 362 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ING2Q9H160 280 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 SLC38A1Q9H2H9 487 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ABI3Q9P2A4 366 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 POMPQ9Y244 141 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 IFT52Q9Y366 437 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 WDR45Q9Y484 360 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 KCNE3Q9Y6H6 103 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 DOCK10Q96BY6 2186 aa11.13□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 NPIPB9F8W1W9 429 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 CXCR6O00574 342 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 GSTA4O15217 222 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 SLC28A2O43868 658 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 PPM1BO75688 479 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 CIB2O75838 187 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 H6PDO95479 791 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 BCHEP06276 602 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 CHRM4P08173 479 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ADH7P40394 386 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 POLE2P56282 527 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 TMPRSS3P57727 454 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF141Q15928 474 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 SYPL1Q16563 259 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 NTRK2Q16620 822 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 GLYATQ6IB77 296 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 LYPD8Q6UX82 237 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 IFNEQ86WN2 208 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 DHFR2Q86XF0 187 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 CMIPQ8IY22 773 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ANKFN1Q8N957 763 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 NFKBIDQ8NI38 313 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 PIK3R3Q92569 461 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 MAL2Q969L2 176 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 RASL10BQ96S79 203 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 UBQLN4Q9NRR5 601 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 RPS6KA6Q9UK32 745 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ABCG2Q9UNQ0 655 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 A0A1W2PQD3 144 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 GXYLT2A0PJZ3 443 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 AGAP5A6NIR3 686 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 SYT5O00445 386 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ARPC2O15144 300 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 HS6ST1O60243 411 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 ITGA10O75578 1167 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 OR2J2O76002 312 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 PDE5AO76074 875 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 C8BP07358 591 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 UMPSP11172 480 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 TBXA2RP21731 343 aa11.11□□□□□ -0.63
HDLBP-215ENST00000427487 IL12BP29460 328 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms