RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 ESM1Q9NQ30 184 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 CUTCQ9NTM9 273 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 IMPAD1Q9NX62 359 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUDCQ9Y266 331 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 DHRS7Q9Y394 339 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A0J9YVX5 310 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRIT2A6NDA9 550 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM220BPB1ANY3 271 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 CFLARO15519 480 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADAM12O43184 909 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRTM2O43300 516 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSC22D2O75157 780 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 GJB5O95377 273 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRAMEF12O95522 483 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGSF6O95976 241 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 ETS1P14921 441 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 PVRP15151 417 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP11B1P15538 503 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 FASP25445 335 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 AKT2P31751 481 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMGCLP35914 325 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAG2P55895 527 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYBPC1Q00872 1141 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF33BQ06732 778 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX1Q13596 522 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 RUNX3Q13761 415 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 TGIF1Q15583 401 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZIC1Q15915 447 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNPY1Q3B7I2 92 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT71Q3SY84 523 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC22A6Q4U2R8 563 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 OLFML2AQ68BL7 652 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAB12Q6IQ22 244 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRR5LQ6MZQ0 368 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 CGB2Q6NT52 195 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 GCNT7Q6ZNI0 430 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPBP1Q86WP2 473 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 NAXDQ8IW45 347 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPD1LQ8N335 351 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPEM1Q8N4L4 309 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 HDDC3Q8N4P3 179 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF148Q8N7C7 305 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARL10Q8N8L6 244 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 MINDY2Q8NBR6 621 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM71CQ8NEG0 241 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR4F17Q8NGA8 305 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 RHOXF1Q8NHV9 184 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRAPQ8TCY5 172 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 LHX4Q969G2 390 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 NCLNQ969V3 563 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAB3CQ96E17 227 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAJA3Q96EY1 480 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR4F4Q96R69 305 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSPAN18Q96SJ8 248 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 APOOQ9BUR5 198 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 NACA2Q9H009 215 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCG8Q9H221 673 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 HSD3B7Q9H2F3 369 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 NINJ2Q9NZG7 142 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPASTQ9UBP0 616 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL20RAQ9UHF4 553 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 METP08581 1390 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM168BA1KXE4 195 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRABD2BA6NFA1 517 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 MFSD2BA6NFX1 497 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCT8L1PA6NM43 557 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 IMPA2O14732 288 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 SSX5O60225 188 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 RHBDL1O75783 438 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFA7O95182 113 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 MT-ATP6P00846 226 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC35G4P0C7Q5 338 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC192P0DO97 292 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 UMPSP11172 480 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 LAMP1P11279 417 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL10P22301 178 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPN6P29350 595 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRDX6P30041 224 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR1D4P47884 311 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-377P-201ENST00000515965 POU3F4P49335 361 aa2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms