RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 ABHD17BQ5VST6 288 aa16.94■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 MSRB3Q8IXL7 192 aa16.94■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF675Q8TD23 568 aa16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 GRHL3Q8TE85 626 aa16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 TAS2R1Q9NYW7 299 aa16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 STMN3Q9NZ72 180 aa16.94■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 VAPAQ9P0L0 249 aa16.94■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.93■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 GMEB1Q9Y692 573 aa16.93■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 PTGER1P34995 402 aa16.92■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 GPC1P35052 558 aa16.92■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 ACER2Q5QJU3 275 aa16.92■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.92■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 PGAM4Q8N0Y7 254 aa16.92■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 FAR1Q8WVX9 515 aa16.92■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 ELP4Q96EB1 424 aa16.92■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa16.92■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16.92■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 MAT2BQ9NZL9 334 aa16.92■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 NTMQ9P121 344 aa16.92■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 CROCCQ5TZA2 2017 aa16.92■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 BEST3Q8N1M1 668 aa16.91■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa16.91■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 ADCY4Q8NFM4 1077 aa16.91■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 PRR7Q8TB68 274 aa16.91■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 ELP5Q8TE02 316 aa16.91■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 ZFP90Q8TF47 636 aa16.91■□□□□ 0.3
PTX4-201ENST00000293922 RIT1Q92963 219 aa16.91■□□□□ 0.3
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PTX4-201ENST00000293922 TAAR6Q96RI8 345 aa16.91■□□□□ 0.3
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