RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ARID1A	O14497	2285 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	HMX2	A2RU54	273 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf72	A6NCS6	295 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPN14	A8MX76	684 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	IL18BP	O95998	194 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	INHBB	P09529	407 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CPM	P14384	443 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3R1	P27986	724 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OPRM1	P35372	400 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF2H2	Q13888	395 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GRTP1	Q5TC63	336 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	LUZP2	Q86TE4	346 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	HGD	Q93099	445 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NODAL	Q96S42	347 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ITPA	Q9BY32	194 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CALHM2	Q9HA72	323 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR41	Q9HAD4	459 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SERHL	Q9NQF3	203 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	EHD3	Q9NZN3	535 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	WHRN	Q9P202	907 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GTL3	188 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3D21	A4FU49	640 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OR7A17	O14581	309 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SNPH	O15079	494 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SIAH2	O43255	324 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	RAD51C	O43502	376 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	UGDH	O60701	494 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PPM1B	O75688	479 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA3D	O95025	777 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GFAP	P14136	432 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NT5E	P21589	574 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CNTF	P26441	200 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CRABP2	P29373	138 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NRG3	P56975	720 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GNG11	P61952	73 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PHEX	P78562	749 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	DUSP2	Q05923	314 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	MGAT2	Q10469	447 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	RCAN2	Q14206	197 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	10.86	□□□□□ -0.67	3e-11	■■■■■ 52.9
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FBF1	Q8TES7	1133 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	REPS1	Q96D71	796 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ARSG	Q96EG1	525 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR78	Q96P69	363 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ERP44	Q9BS26	406 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	IPPK	Q9H8X2	491 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FETUB	Q9UGM5	382 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SYCE1L	A8MT33	242 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338		B4DXG7	233 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338		H0Y3Z8	333 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ICOSLG	O75144	302 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT2B11	O75310	529 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GOSR1	O95249	250 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTL6A	O96019	429 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	C2	P06681	752 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	KLK1	P06870	262 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP4B1	P13584	511 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CPN1	P15169	458 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	XK	P51811	444 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SRY	Q05066	204 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CALCOCO2	Q13137	446 aa		10.85	□□□□□ -0.67

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