RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530295.5

NDUFS3-208, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, human

TSL 3

Gene NDUFS3, Length 253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS3-208	ENST00000530295	SIAH2	O43255	324 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	STK16	O75716	305 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	RCBTB2	O95199	551 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	NID1	P14543	1247 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	SSTR4	P31391	388 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	GCK	P35557	465 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	CASP3	P42574	277 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	FAM27E3	Q08E93	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	BIK	Q13323	160 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	LAPTM5	Q13571	262 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	GPR180	Q86V85	440 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	RDH11	Q8TC12	318 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	TANK	Q92844	425 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	OR51B5	Q9H339	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PIGM	Q9H3S5	423 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ABCA1	O95477	2261 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	C2orf72	A6NCS6	295 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	OR6C76	A6NM76	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	CRLF1	O75462	422 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ACTL6A	O96019	429 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	CLPS	P04118	112 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PTPN6	P29350	595 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ELK3	P41970	407 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	RAP1GDS1	P52306	607 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	TNFRSF17	Q02223	184 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	GPSM1	Q86YR5	675 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	RNF175	Q8N4F7	328 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	MED18	Q9BUE0	208 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	SNX15	Q9NRS6	342 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	CD274	Q9NZQ7	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295		A8MXE2	369 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	WIPF1	O43516	503 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	SCEL	O95171	688 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	GPR75	O95800	540 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	KRT15	P19012	456 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PTH2R	P49190	550 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	STAR	P49675	285 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	SLC12A2	P55011	1212 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	NRG3	P56975	720 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	MED27	Q6P2C8	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	EXT2	Q93063	718 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	WNT2B	Q93097	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	TP53INP1	Q96A56	240 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	SERHL	Q9NQF3	203 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PHF11	Q9UIL8	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	CPN1	P15169	458 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NDUFS3-208	ENST00000530295	GGT5	P36269	586 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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