RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GTL3 188 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PPR1 153 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 ATP8B1O43520 1251 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 ERLIN1O75477 346 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 ATE1O95260 518 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 CLPSP04118 112 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 TNNI3P19429 210 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 DNASE1P24855 282 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 FNTAP49354 379 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 HNMTP50135 292 aa6□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 PPP2R2AP63151 447 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 STX4Q12846 297 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 TGFBIQ15582 683 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 MPEG1Q2M385 716 aa6□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 TEX35Q5T0J7 233 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM40Q6P9F5 258 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 OPN5Q6U736 354 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 PAMR1Q6UXH9 720 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 GGNQ86UU5 652 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 KRT78Q8N1N4 520 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 ACOT4Q8N9L9 421 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 TTLQ8NG68 377 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 OR10G3Q8NGC4 313 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 NEIL3Q8TAT5 605 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 NUBPLQ8TB37 319 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 ABHD4Q8TB40 342 aa6□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 MBD6Q96DN6 1003 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 WDR34Q96EX3 536 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 NAT9Q9BTE0 207 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 MS4A8Q9BY19 250 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 EXO5Q9H790 373 aa6□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 SNX12Q9UMY4 172 aa6□□□□□ -1.45
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HOXD8-202ENST00000429017 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 LINC01560Q8TB33 94 aa5.99□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 ACTRT1Q8TDG2 376 aa5.99□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.99□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 FAM222BQ8WU58 562 aa5.99□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
HOXD8-202ENST00000429017 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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