RNA–Protein interactions for RNA: YGR035C

YGR035C, Transcript of Putative protein of unknown function, potential Cdc28p substrate, yeast

Gene YGR035C, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR035C	YGR035C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
YGR035C	YGR035C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.84	□□□□□ -1.79	not detected
YGR035C	YGR035C	NPP2	P39997	493 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YGR035C	YGR035C	NCS6	P53088	359 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YGR035C	YGR035C	SFB2	P53953	876 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YGR035C	YGR035C	NPC2	Q12408	173 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YGR035C	YGR035C	LAS17	Q12446	633 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YGR035C	YGR035C	MBP1	P39678	833 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	PPM2	Q08282	695 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	KAR4	P25583	335 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	MOH1	P38191	138 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	ENB1	Q08299	606 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	OAR1	P35731	278 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	GDE1	Q02979	1223 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	ATG19	P35193	415 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	SUL1	P38359	859 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	UBA2	P52488	636 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	YLR040C	Q07988	224 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	YML122C	Q03207	126 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	YPR196W	Q06595	470 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	YOL073C	Q08232	322 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	GUP2	Q08929	609 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	UPC2	Q12151	913 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	GYP7	P48365	746 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	BUL1	P48524	976 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	TAF7	Q05021	590 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YGR035C	YGR035C	SED4	P25365	1065 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	AGP1	P25376	633 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	RPC82	P32349	654 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	CWC24	P53769	259 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	ERG4	P25340	473 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	STE14	P32584	239 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	VBA5	P36172	582 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	KTR4	P38131	464 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	YER158C	P40095	573 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	STB4	P50104	949 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	YMR206W	Q03695	313 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	RIP-Chip
YGR035C	YGR035C	YDR306C	Q06640	478 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	MAD1	P40957	749 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.74	□□□□□ -1.81	not detected
YGR035C	YGR035C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	TMN2	Q04562	672 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	OPI10	Q08202	246 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	TRM13	Q12383	476 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	CLN2	P20438	545 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	PRI2	P20457	528 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	NPP1	P25353	742 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	PPH3	P32345	308 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	MCH5	Q08777	521 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	ADE8	P04161	214 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	RPD3	P32561	433 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	YKL069W	P36088	180 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	YKE2	P52553	114 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	RNT1	Q02555	471 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	VPS16	Q03308	798 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	SHE9	Q04172	456 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGR035C	YGR035C	ALG7	P07286	448 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	AFR1	P33304	620 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	STE13	P33894	931 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	YRO2	P38079	344 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	ERG5	P54781	538 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	MUK1	Q02866	612 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	PEX19	Q07418	342 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	PIN2	Q12057	282 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	ACF2	Q12168	779 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	STU2	P46675	888 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	FBP1	P09201	348 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	VPS30	Q02948	557 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	OMS1	Q06668	471 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	ERT1	P38140	529 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	SDP1	P40479	209 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	TIM44	Q01852	431 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	IRC10	Q08118	586 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YGR035C	YGR035C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82

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