RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W IMD4P50094 524 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W CRN1Q06440 651 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W BUG1Q12191 341 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YPR089WO13585 888 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W PGI1P12709 554 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DIT2P21595 489 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W PGS1P25578 521 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MEI4P29467 408 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W EUG1P32474 517 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SFA1P32771 386 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W AFR1P33304 620 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SPT8P38915 602 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ZRG8P40021 1076 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W DOT6P40059 670 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YGR067CP53243 804 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YKR005CQ02203 525 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W OMS1Q06668 471 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MLH2Q07980 695 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TRM8Q12009 286 aa5.48□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W PDE2P06776 526 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TOM70P07213 617 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MSH2P25847 964 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MIF2P35201 549 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W TIF5P38431 405 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W FMS1P50264 508 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ATG1P53104 897 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W UBP2Q01476 1272 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W CST9Q06032 482 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SOG2Q08817 791 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RTP1Q12751 981 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W BNI1P41832 1953 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W NMT1P14743 455 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ATE1P16639 503 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SEC2P17065 759 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RPC53P25441 422 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W RSC6P25632 483 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W GRX7P38068 203 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W PIH1P38768 344 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YER156CP40093 338 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W VTC2P43585 828 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W NUP42P49686 430 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data5.47□□□□□ -1.53not detected
CYK3YDL117W TAF12Q03761 539 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W ATP16Q12165 160 aa5.47□□□□□ -1.53
CYK3YDL117W SUI2P20459 304 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MEF1P25039 761 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RAD27P26793 382 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W KRE6P32486 720 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SMI1P32566 505 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MNN2P38069 597 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W NUP85P46673 744 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RPA14P50106 137 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MUB1Q03162 620 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ADE3P07245 946 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PWP1P21304 576 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W CLB3P24870 427 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VPH1P32563 840 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PEX6P33760 1030 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W OCT1P35999 772 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MRPL10P36520 322 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W BOI1P38041 980 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W KIC1P38692 1080 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RRF1P38771 230 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W FCY21P40039 528 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SBE2P42223 864 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SPO1P53541 631 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ATG9Q12142 997 aa5.46□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W NUP159P40477 1460 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MLP2P40457 1679 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SPS1P08458 490 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W PMR1P13586 950 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W STO1P34160 861 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W VID27P40157 782 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W HOL1P53389 586 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ALF1P53904 254 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W MCD1Q12158 566 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W DNF1P32660 1571 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W GCN2P15442 1659 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W ERG12P07277 443 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RED1P14291 827 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W GLK1P17709 500 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W KCC4P25389 1037 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W DOM34P33309 386 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W RRT14P40470 206 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YIL001WP40560 513 aa5.45□□□□□ -1.54
CYK3YDL117W YJL007CP47080 104 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.1 ms