RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628659.2

PCBP1-AS1-331, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 922 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PHOX2BQ99453 314 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ITSN1Q15811 1721 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 IRF6O14896 467 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MAP2K5Q13163 448 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SMIM5Q71RC9 77 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 NLRP7Q8WX94 980 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 RGPD5Q99666 1765 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 FSTL1Q12841 308 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CDK19Q9BWU1 502 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SLC10A3P09131 477 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 RRAGCQ9HB90 399 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 BCS1LQ9Y276 419 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 COL18A1P39060 1754 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 FOXN1O15353 648 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SLC4A3P48751 1232 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 NECTIN2Q92692 538 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ABCC6O95255 1503 aa8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ZMYND10O75800 440 aa8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 KCNC4Q03721 635 aa8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PIK3C2AO00443 1686 aa8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ADGRB1O14514 1584 aa8.28□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CCDC7Q96M83 1385 aa8.28□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.28□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ABHD8Q96I13 439 aa8.28□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MTRQ99707 1265 aa8.28□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 IL2RBP14784 551 aa8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ZNF516Q92618 1163 aa8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CCDC102AQ96A19 550 aa8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SLIT3O75094 1523 aa8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 A0A0G2JLW4 131 aa8.26□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.26□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.26□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 KDM2BQ8NHM5 1336 aa8.26□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 LBX1P52954 281 aa8.25□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.25□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 IL21Q9HBE4 155 aa8.25□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 RNF181Q9P0P0 153 aa8.25□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 LY75O60449 1722 aa8.24□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CFHP08603 1231 aa8.24□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 AIDAQ96BJ3 306 aa8.24□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PRR14Q9BWN1 585 aa8.24□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.24□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.23□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.23□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.23□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 COPS2P61201 443 aa8.23□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.23□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.23□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 NSD2O96028 1365 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 DPEP1P16444 411 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 AK7Q96M32 723 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 CABP1Q9NZU7 370 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 USP47Q96K76 1375 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 C5P01031 1676 aa8.21□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MMP10P09238 476 aa8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 USP54Q70EL1 1684 aa8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ZPR1O75312 459 aa8.2□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 GCGRP47871 477 aa8.2□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.2□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 SULF1Q8IWU6 871 aa8.2□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 RDH13Q8NBN7 331 aa8.2□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-331ENST00000628659 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms