RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603487.1

SMC2-AS1-201, Transcript of SMC2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC2-AS1, Length 7,020 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PFDN4Q9NQP4 134 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SH3BP5O60239 455 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RLBP1P12271 317 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PDE4AP27815 886 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PTPN14Q15678 1187 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RINLQ6ZS11 566 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CCDC68Q9H2F9 335 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GAPVD1Q14C86 1478 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 E9PMD0 336 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NDC80O14777 642 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MAN1A2O60476 641 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MX2P20592 715 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SART3Q15020 963 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NFXL1Q6ZNB6 911 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.75□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 UNC13AQ9UPW8 1703 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ARAP1Q96P48 1450 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CAPN2P17655 700 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TNIP1Q15025 636 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 AMOTL1Q8IY63 956 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KIF18AQ8NI77 898 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SLC8A1P32418 973 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PRPHP41219 470 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MIA2Q96PC5 1412 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NBNO60934 754 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RCAN3Q9UKA8 241 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TRIM17Q9Y577 477 aa5.74□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PDCLQ13371 301 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HVCN1Q96D96 273 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 STAC3Q96MF2 364 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GRPEL1Q9HAV7 217 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KIF7Q2M1P5 1343 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KRT18P05783 430 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RANBP1P43487 201 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PHEXP78562 749 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SH3GL2Q99962 352 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DACH1Q9UI36 760 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 OPHN1O60890 802 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KRT10P13645 584 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 BIRC2Q13490 618 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CCDC144BQ3MJ40 725 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TOPBP1Q92547 1522 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DEUP1Q05D60 604 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CCDC89Q8N998 374 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CDCA8Q53HL2 280 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa5.73□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CCDC192P0DO97 292 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KIF22Q14807 665 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KRBA2Q6ZNG9 492 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TRDNQ13061 729 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CCDC102BQ68D86 513 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TRIML1Q8N9V2 468 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TTC14Q96N46 770 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ERICH2A1L162 156 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PAFAH1B1P43034 410 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TRIM7Q9C029 511 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SCINQ9Y6U3 715 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZSCAN12O43309 604 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KCNA4P22459 653 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZSCAN30Q86W11 494 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LRRC45Q96CN5 670 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IFT74Q96LB3 600 aa5.72□□□□□ -1.49
SMC2-AS1-201ENST00000603487 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.4 ms