RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592701.2

EFTUD2-224, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-224	ENST00000592701	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	RGS3	P49796	1198 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	BTAF1	O14981	1849 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	GRM8	O00222	908 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	ITPK1	Q13572	414 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	ARX	Q96QS3	562 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	GCKR	Q14397	625 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-224	ENST00000592701	UTY	O14607	1347 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	RXRB	P28702	533 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	NUCB1	Q02818	461 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	RREB1	Q92766	1687 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701		A0A087WZG4	1122 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	MTX1	Q13505	466 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	POLA2	Q14181	598 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	PDE4A	P27815	886 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	KCNQ4	P56696	695 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	COL15A1	P39059	1388 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-224	ENST00000592701	LY75	O60449	1722 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701		H7C1W4	665 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	APBB1	O00213	710 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	TRIM37	O94972	964 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	HLF	Q16534	295 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	CASP7	P55210	303 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	GPT	P24298	496 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	GNPAT	O15228	680 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.61	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms