RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.17■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.16■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.16■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.16■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.16■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 HOXB7P09629 217 aa24.15■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.15■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.15■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.15■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.15■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.14■■□□□ 1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 CCER2I3L3R5 266 aa24.14■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.14■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.13■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 RGL2O15211 777 aa24.13■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNA3P22001 575 aa24.13■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 CHRNA5P30532 468 aa24.13■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.13■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 IL16Q14005 1332 aa24.12■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 COPS6Q7L5N1 327 aa24.11■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR63Q8IWG1 891 aa24.11■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 TSPYL6Q8N831 410 aa24.11■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.11■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 GRIN3BO60391 1043 aa24.1■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 CNBD1Q8NA66 436 aa24.1■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM177BA6PVY3 158 aa24.09■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 NPHP1O15259 732 aa24.09■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 MIER1Q8N108 512 aa24.08■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 BCS1LQ9Y276 419 aa24.08■■□□□ 1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 GPTP24298 496 aa24.07■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 YY1P25490 414 aa24.07■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 PIM2Q9P1W9 311 aa24.07■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.07■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.06■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.06■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP10DQ9P241 1426 aa24.06■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 NUP98P52948 1817 aa24.05■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 ST5P78524 1137 aa24.05■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.05■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.04■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.04■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 HYPKQ9NX55 129 aa24.04■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.03■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 H0YIN7 160 aa24.03■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 PDE6BP35913 854 aa24.03■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 SUSD4Q5VX71 490 aa24.02■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF521Q96K83 1311 aa24.02■■□□□ 1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.01■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.01■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 GOLGA2Q08379 1002 aa24■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 PLBD2Q8NHP8 589 aa24■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 ERFEQ4G0M1 354 aa23.99■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 NYXQ9GZU5 481 aa23.99■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 TCIRG1Q13488 830 aa23.98■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.98■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 NTSR2O95665 410 aa23.97■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 PARP10Q53GL7 1025 aa23.97■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.97■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.97■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 TTLL6Q8N841 843 aa23.97■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF428Q96B54 188 aa23.97■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCC12Q96J65 1359 aa23.97■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.97■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.97■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 CHD4Q14839 1912 aa23.96■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.96■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 SRGNP10124 158 aa23.96■■□□□ 1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 VAMP4O75379 141 aa23.95■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.95■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 NLRP10Q86W26 655 aa23.95■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.94■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 STK31Q9BXU1 1019 aa23.94■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.93■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 STYK1Q6J9G0 422 aa23.93■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 MASTLQ96GX5 879 aa23.93■■□□□ 1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.92■■□□□ 1.42
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