RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556333.1

RCCD1-205, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 735 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-205ENST00000556333 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.03■■□□□ 1.76
RCCD1-205ENST00000556333 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.03■■□□□ 1.76
RCCD1-205ENST00000556333 CAMTA2O94983 1202 aa26.02■■□□□ 1.76
RCCD1-205ENST00000556333 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
RCCD1-205ENST00000556333 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.02■■□□□ 1.76
RCCD1-205ENST00000556333 SLFN5Q08AF3 891 aa26.01■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.01■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.01■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 STK31Q9BXU1 1019 aa26■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.99■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 COPS6Q7L5N1 327 aa25.99■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.99■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 HYPKQ9NX55 129 aa25.99■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.98■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 NFIXQ14938 502 aa25.98■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.98■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 SYT17Q9BSW7 474 aa25.98■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 TM4SF1P30408 202 aa25.97■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.97■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 VAMP4O75379 141 aa25.96■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 HLFQ16534 295 aa25.96■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.96■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.96■■□□□ 1.75
RCCD1-205ENST00000556333 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.95■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 DDR1Q08345 913 aa25.95■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 SETDB2Q96T68 719 aa25.95■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 UTRNP46939 3433 aa25.94■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.94■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.94■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 NPHP1O15259 732 aa25.93■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 SLC4A2P04920 1241 aa25.92■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 SERPINB2P05120 415 aa25.92■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.92■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 RGL2O15211 777 aa25.91■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.9■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.9■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 FAM177BA6PVY3 158 aa25.89■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.89■■□□□ 1.74
RCCD1-205ENST00000556333 GPTP24298 496 aa25.88■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 C1QTNF8P60827 252 aa25.88■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.88■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.88■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 ATP10DQ9P241 1426 aa25.87■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.86■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.86■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.85■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 G2E3Q7L622 706 aa25.85■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.85■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 CNBD1Q8NA66 436 aa25.84■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.83■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 TCIRG1Q13488 830 aa25.83■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.83■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.83■■□□□ 1.73
RCCD1-205ENST00000556333 ST5P78524 1137 aa25.82■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 FLIIQ13045 1269 aa25.82■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.82■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.82■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.82■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.81■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 NYXQ9GZU5 481 aa25.81■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 PARP10Q53GL7 1025 aa25.8■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.8■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 CACNA1SQ13698 1873 aa25.8■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 TGFB2P61812 414 aa25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 SUSD4Q5VX71 490 aa25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 KSR2Q6VAB6 950 aa25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 ZNF428Q96B54 188 aa25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 MYD88Q99836 296 aa25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.79■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.78■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 GPR162Q16538 588 aa25.78■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 A0A0G2JLW4 131 aa25.77■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.77■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.77■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 ADCY9O60503 1353 aa25.77■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.77■■□□□ 1.72
RCCD1-205ENST00000556333 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.76■■□□□ 1.71
RCCD1-205ENST00000556333 NLRP10Q86W26 655 aa25.76■■□□□ 1.71
RCCD1-205ENST00000556333 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.76■■□□□ 1.71
RCCD1-205ENST00000556333 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 183.6 ms