RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	GRM8	O00222	908 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	SIK1	P57059	783 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDE4A	P27815	886 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	GCKR	Q14397	625 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	SSH3	Q8TE77	659 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP1CC-208	ENST00000551676	MTX1	Q13505	466 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	POLA2	Q14181	598 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	LNPK	Q9C0E8	428 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	ITPK1	Q13572	414 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	RREB1	Q92766	1687 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	KAZALD1	Q96I82	304 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	SUCLG2	Q96I99	432 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	BACH2	Q9BYV9	841 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	COL15A1	P39059	1388 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP1CC-208	ENST00000551676	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	SRGAP3	O43295	1099 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	CASP7	P55210	303 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM161A	Q3B820	660 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	BTAF1	O14981	1849 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676		H7C1W4	665 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A087WZG4	1122 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	SBF2	Q86WG5	1849 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	C8orf34	Q49A92	452 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
PPP1CC-208	ENST00000551676	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	RAB11FIP3	O75154	756 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	HLF	Q16534	295 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	APBB1	O00213	710 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARX	Q96QS3	562 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PPP1CC-208	ENST00000551676	LY75	O60449	1722 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	FOXO4	P98177	505 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	CAMTA2	O94983	1202 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	NLRP10	Q86W26	655 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	KCNQ4	P56696	695 aa		31.83	■■■□□ 2.69

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