RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.26■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 NECTIN2Q92692 538 aa29.26■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 SETDB2Q96T68 719 aa29.26■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 HLFQ16534 295 aa29.25■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 ANXA1P04083 346 aa29.24■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.24■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.23■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.23■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 KCNA3P22001 575 aa29.23■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.23■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 GRIN3BO60391 1043 aa29.22■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.22■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.21■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CCDC189-211ENST00000545825 CHRNA5P30532 468 aa29.2■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 IL16Q14005 1332 aa29.2■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.19■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.19■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 YY1P25490 414 aa29.18■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 CNBD1Q8NA66 436 aa29.18■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.18■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 CCER2I3L3R5 266 aa29.17■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.17■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 ATP10DQ9P241 1426 aa29.17■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 COPS6Q7L5N1 327 aa29.16■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 NUP98P52948 1817 aa29.15■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa29.15■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 WDR63Q8IWG1 891 aa29.15■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.15■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 BRIP1Q9BX63 1249 aa29.15■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 PIM2Q9P1W9 311 aa29.15■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 BCS1LQ9Y276 419 aa29.15■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
CCDC189-211ENST00000545825 NPHP1O15259 732 aa29.13■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 TSPYL6Q8N831 410 aa29.13■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 CHD4Q14839 1912 aa29.13■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 ST5P78524 1137 aa29.12■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.12■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.11■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 PDE6BP35913 854 aa29.11■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.11■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.11■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 FAM177BA6PVY3 158 aa29.1■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 H0YIN7 160 aa29.1■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 GPTP24298 496 aa29.1■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.1■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.1■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 HYPKQ9NX55 129 aa29.09■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.08■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CCDC189-211ENST00000545825 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.06■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF521Q96K83 1311 aa29.06■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 SUSD4Q5VX71 490 aa29.05■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 NYXQ9GZU5 481 aa29.05■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.04■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.04■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.04■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.03■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.03■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.03■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 TTLL6Q8N841 843 aa29.03■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 ABCC12Q96J65 1359 aa29.02■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 NTSR2O95665 410 aa29.02■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 SRGNP10124 158 aa29.02■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 TCIRG1Q13488 830 aa29.02■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 PARP10Q53GL7 1025 aa29.02■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.02■■■□□ 2.24
CCDC189-211ENST00000545825 GOLGA2Q08379 1002 aa29.01■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 ERFEQ4G0M1 354 aa29.01■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.01■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 MIER1Q8N108 512 aa29.01■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 STYK1Q6J9G0 422 aa28.99■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.99■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 NLRP10Q86W26 655 aa28.98■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 MASTLQ96GX5 879 aa28.98■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.97■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CCDC189-211ENST00000545825 CNKSR1Q969H4 720 aa28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms