RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 APAF1O14727 1248 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 PDE6BP35913 854 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC184Q52MB2 194 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 NGEFQ8N5V2 710 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 H0YIN7 160 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 NPHP1O15259 732 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 MYL6BP14649 208 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 ST5P78524 1137 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 HLFQ16534 295 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 ATP10DQ9P241 1426 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 CFAP44Q96MT7 982 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 NUP98P52948 1817 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 TTLL6Q8N841 843 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 PDIA6Q15084 440 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD8-204ENST00000544999 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 HOXB7P09629 217 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 KRT24Q2M2I5 525 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 MRS2Q9HD23 443 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF853P0CG23 659 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 PROSER3Q2NL68 480 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 MBIPQ9NS73 344 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 IFT57Q9NWB7 429 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 SRGNP10124 158 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 GNAI1P63096 354 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 STYK1Q6J9G0 422 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 NECTIN2Q92692 538 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 NYXQ9GZU5 481 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 FAM177BA6PVY3 158 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 ANXA1P04083 346 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 CNKSR1Q969H4 720 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 MASTLQ96GX5 879 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 SBF1O95248 1867 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-204ENST00000544999 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 UBN2Q6ZU65 1347 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 GPTP24298 496 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC27Q2M243 656 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 COPS6Q7L5N1 327 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 CACNA1SQ13698 1873 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 NPR1P16066 1061 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 RASSF7Q02833 373 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 RNF181Q9P0P0 153 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 SLX4Q8IY92 1834 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 C1QTNF8P60827 252 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 PARP10Q53GL7 1025 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 SUSD4Q5VX71 490 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 ABCC12Q96J65 1359 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 C21orf2O43822 256 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-204ENST00000544999 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 NTSR2O95665 410 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 ERFEQ4G0M1 354 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 NFKBIEO00221 500 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 LMNB1P20700 586 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 SOGA3Q5TF21 947 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 WWC1Q8IX03 1113 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 HYPKQ9NX55 129 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 PRELPP51888 382 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 TCIRG1Q13488 830 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 CRY2Q49AN0 593 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-204ENST00000544999 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms