RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 PROSER3Q2NL68 480 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 NGEFQ8N5V2 710 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.22■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.22■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.21■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 HOXB7P09629 217 aa25.21■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 GNAI1P63096 354 aa25.21■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 WWC1Q8IX03 1113 aa25.2■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 NUP98P52948 1817 aa25.2■■□□□ 1.63
SLC43A3-217ENST00000530005 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 ANXA1P04083 346 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 PIM2Q9P1W9 311 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 BCS1LQ9Y276 419 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 NECTIN2Q92692 538 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 CNBD1Q8NA66 436 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 ATP10DQ9P241 1426 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.14■■□□□ 1.62
SLC43A3-217ENST00000530005 COPS6Q7L5N1 327 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 IL16Q14005 1332 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 PDE6BP35913 854 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 H0YIN7 160 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 ST5P78524 1137 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 ADCY9O60503 1353 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 NPHP1O15259 732 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 TSPYL6Q8N831 410 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM177BA6PVY3 158 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 SRGNP10124 158 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 GPTP24298 496 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 TTLL6Q8N841 843 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SLC43A3-217ENST00000530005 ABCC12Q96J65 1359 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 SUSD4Q5VX71 490 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 WDR63Q8IWG1 891 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 HYPKQ9NX55 129 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 NTSR2O95665 410 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 NYXQ9GZU5 481 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 STYK1Q6J9G0 422 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.64e-6■□□□□ 9.9
SLC43A3-217ENST00000530005 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 ERFEQ4G0M1 354 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 PARP10Q53GL7 1025 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 TCIRG1Q13488 830 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 MASTLQ96GX5 879 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 SLX4Q8IY92 1834 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF521Q96K83 1311 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 CCER2I3L3R5 266 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC43A3-217ENST00000530005 CRY2Q49AN0 593 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 CNKSR1Q969H4 720 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 SBF1O95248 1867 aa25■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC30Q5VVM6 783 aa25■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 NLRP10Q86W26 655 aa25■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 NPR1P16066 1061 aa24.99■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 CACNA1SQ13698 1873 aa24.98■■□□□ 1.59
SLC43A3-217ENST00000530005 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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