RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 CFAP44Q96MT7 982 aa24.08■■□□□ 1.45
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TSPAN4-216ENST00000526055 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.07■■□□□ 1.44
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TSPAN4-216ENST00000526055 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.06■■□□□ 1.44
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TSPAN4-216ENST00000526055 MRS2Q9HD23 443 aa24.01■■□□□ 1.43
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TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.97■■□□□ 1.43
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.97■■□□□ 1.43
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TSPAN4-216ENST00000526055 PARP10Q53GL7 1025 aa23.95■■□□□ 1.42
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TSPAN4-216ENST00000526055 COPS6Q7L5N1 327 aa23.93■■□□□ 1.42
TSPAN4-216ENST00000526055 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
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TSPAN4-216ENST00000526055 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.9■■□□□ 1.42
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TSPAN4-216ENST00000526055 GPTP24298 496 aa23.9■■□□□ 1.42
TSPAN4-216ENST00000526055 WWC1Q8IX03 1113 aa23.9■■□□□ 1.42
TSPAN4-216ENST00000526055 RNF181Q9P0P0 153 aa23.9■■□□□ 1.42
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TSPAN4-216ENST00000526055 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
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TSPAN4-216ENST00000526055 C21orf2O43822 256 aa23.88■■□□□ 1.41
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TSPAN4-216ENST00000526055 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.87■■□□□ 1.41
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TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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TSPAN4-216ENST00000526055 RASSF7Q02833 373 aa23.86■■□□□ 1.41
TSPAN4-216ENST00000526055 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
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TSPAN4-216ENST00000526055 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.85■■□□□ 1.41
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.84■■□□□ 1.41
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